Protein–RNA interactions for Protein: Q96IW7

SEC22A, Vesicle-trafficking protein SEC22a, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC22AQ96IW7 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SEC22AQ96IW7 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SEC22AQ96IW7 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SEC22AQ96IW7 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SEC22AQ96IW7 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SEC22AQ96IW7 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SEC22AQ96IW7 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SEC22AQ96IW7 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SEC22AQ96IW7 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SEC22AQ96IW7 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SEC22AQ96IW7 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SEC22AQ96IW7 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SEC22AQ96IW7 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SEC22AQ96IW7 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SEC22AQ96IW7 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SEC22AQ96IW7 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SEC22AQ96IW7 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SEC22AQ96IW7 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SEC22AQ96IW7 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SEC22AQ96IW7 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SEC22AQ96IW7 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SEC22AQ96IW7 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SEC22AQ96IW7 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SEC22AQ96IW7 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SEC22AQ96IW7 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SEC22AQ96IW7 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SEC22AQ96IW7 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SEC22AQ96IW7 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SEC22AQ96IW7 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SEC22AQ96IW7 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SEC22AQ96IW7 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SEC22AQ96IW7 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SEC22AQ96IW7 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SEC22AQ96IW7 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SEC22AQ96IW7 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SEC22AQ96IW7 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SEC22AQ96IW7 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SEC22AQ96IW7 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SEC22AQ96IW7 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SEC22AQ96IW7 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SEC22AQ96IW7 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SEC22AQ96IW7 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SEC22AQ96IW7 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SEC22AQ96IW7 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SEC22AQ96IW7 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEC22AQ96IW7 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEC22AQ96IW7 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEC22AQ96IW7 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEC22AQ96IW7 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEC22AQ96IW7 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEC22AQ96IW7 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEC22AQ96IW7 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEC22AQ96IW7 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEC22AQ96IW7 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEC22AQ96IW7 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEC22AQ96IW7 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEC22AQ96IW7 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEC22AQ96IW7 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEC22AQ96IW7 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEC22AQ96IW7 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEC22AQ96IW7 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEC22AQ96IW7 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEC22AQ96IW7 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEC22AQ96IW7 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEC22AQ96IW7 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEC22AQ96IW7 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEC22AQ96IW7 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEC22AQ96IW7 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEC22AQ96IW7 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEC22AQ96IW7 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEC22AQ96IW7 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEC22AQ96IW7 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEC22AQ96IW7 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEC22AQ96IW7 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEC22AQ96IW7 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEC22AQ96IW7 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEC22AQ96IW7 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEC22AQ96IW7 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEC22AQ96IW7 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEC22AQ96IW7 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEC22AQ96IW7 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEC22AQ96IW7 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEC22AQ96IW7 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEC22AQ96IW7 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEC22AQ96IW7 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEC22AQ96IW7 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEC22AQ96IW7 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEC22AQ96IW7 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEC22AQ96IW7 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEC22AQ96IW7 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEC22AQ96IW7 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEC22AQ96IW7 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEC22AQ96IW7 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEC22AQ96IW7 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEC22AQ96IW7 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEC22AQ96IW7 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEC22AQ96IW7 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEC22AQ96IW7 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEC22AQ96IW7 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SEC22AQ96IW7 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms