Protein–RNA interactions for Protein: Q96HF1

SFRP2, Secreted frizzled-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 295 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFRP2Q96HF1 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SFRP2Q96HF1 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SFRP2Q96HF1 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SFRP2Q96HF1 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SFRP2Q96HF1 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SFRP2Q96HF1 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SFRP2Q96HF1 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SFRP2Q96HF1 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SFRP2Q96HF1 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SFRP2Q96HF1 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SFRP2Q96HF1 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SFRP2Q96HF1 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SFRP2Q96HF1 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SFRP2Q96HF1 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SFRP2Q96HF1 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SFRP2Q96HF1 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SFRP2Q96HF1 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SFRP2Q96HF1 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SFRP2Q96HF1 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SFRP2Q96HF1 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SFRP2Q96HF1 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SFRP2Q96HF1 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SFRP2Q96HF1 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SFRP2Q96HF1 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SFRP2Q96HF1 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SFRP2Q96HF1 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SFRP2Q96HF1 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SFRP2Q96HF1 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SFRP2Q96HF1 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SFRP2Q96HF1 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SFRP2Q96HF1 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SFRP2Q96HF1 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SFRP2Q96HF1 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SFRP2Q96HF1 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SFRP2Q96HF1 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SFRP2Q96HF1 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SFRP2Q96HF1 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SFRP2Q96HF1 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SFRP2Q96HF1 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SFRP2Q96HF1 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SFRP2Q96HF1 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SFRP2Q96HF1 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SFRP2Q96HF1 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SFRP2Q96HF1 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SFRP2Q96HF1 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SFRP2Q96HF1 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SFRP2Q96HF1 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SFRP2Q96HF1 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SFRP2Q96HF1 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SFRP2Q96HF1 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SFRP2Q96HF1 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SFRP2Q96HF1 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SFRP2Q96HF1 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SFRP2Q96HF1 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SFRP2Q96HF1 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SFRP2Q96HF1 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SFRP2Q96HF1 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SFRP2Q96HF1 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SFRP2Q96HF1 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SFRP2Q96HF1 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SFRP2Q96HF1 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SFRP2Q96HF1 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SFRP2Q96HF1 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SFRP2Q96HF1 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SFRP2Q96HF1 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SFRP2Q96HF1 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SFRP2Q96HF1 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SFRP2Q96HF1 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SFRP2Q96HF1 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SFRP2Q96HF1 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SFRP2Q96HF1 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SFRP2Q96HF1 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SFRP2Q96HF1 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SFRP2Q96HF1 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SFRP2Q96HF1 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SFRP2Q96HF1 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SFRP2Q96HF1 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SFRP2Q96HF1 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SFRP2Q96HF1 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SFRP2Q96HF1 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SFRP2Q96HF1 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SFRP2Q96HF1 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SFRP2Q96HF1 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SFRP2Q96HF1 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SFRP2Q96HF1 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SFRP2Q96HF1 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SFRP2Q96HF1 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SFRP2Q96HF1 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SFRP2Q96HF1 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SFRP2Q96HF1 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SFRP2Q96HF1 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SFRP2Q96HF1 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SFRP2Q96HF1 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SFRP2Q96HF1 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SFRP2Q96HF1 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SFRP2Q96HF1 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SFRP2Q96HF1 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SFRP2Q96HF1 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SFRP2Q96HF1 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SFRP2Q96HF1 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms