Protein–RNA interactions for Protein: Q96GA3

LTV1, Protein LTV1 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTV1Q96GA3 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
LTV1Q96GA3 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
LTV1Q96GA3 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
LTV1Q96GA3 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
LTV1Q96GA3 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
LTV1Q96GA3 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
LTV1Q96GA3 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
LTV1Q96GA3 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
LTV1Q96GA3 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
LTV1Q96GA3 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
LTV1Q96GA3 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
LTV1Q96GA3 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
LTV1Q96GA3 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
LTV1Q96GA3 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
LTV1Q96GA3 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
LTV1Q96GA3 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
LTV1Q96GA3 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
LTV1Q96GA3 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
LTV1Q96GA3 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
LTV1Q96GA3 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
LTV1Q96GA3 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
LTV1Q96GA3 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
LTV1Q96GA3 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
LTV1Q96GA3 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
LTV1Q96GA3 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
LTV1Q96GA3 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
LTV1Q96GA3 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
LTV1Q96GA3 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
LTV1Q96GA3 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
LTV1Q96GA3 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
LTV1Q96GA3 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
LTV1Q96GA3 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
LTV1Q96GA3 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
LTV1Q96GA3 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
LTV1Q96GA3 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
LTV1Q96GA3 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
LTV1Q96GA3 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
LTV1Q96GA3 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
LTV1Q96GA3 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
LTV1Q96GA3 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
LTV1Q96GA3 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
LTV1Q96GA3 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
LTV1Q96GA3 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
LTV1Q96GA3 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
LTV1Q96GA3 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
LTV1Q96GA3 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
LTV1Q96GA3 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
LTV1Q96GA3 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
LTV1Q96GA3 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
LTV1Q96GA3 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
LTV1Q96GA3 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
LTV1Q96GA3 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
LTV1Q96GA3 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
LTV1Q96GA3 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
LTV1Q96GA3 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
LTV1Q96GA3 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
LTV1Q96GA3 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
LTV1Q96GA3 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
LTV1Q96GA3 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
LTV1Q96GA3 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
LTV1Q96GA3 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
LTV1Q96GA3 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
LTV1Q96GA3 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
LTV1Q96GA3 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
LTV1Q96GA3 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
LTV1Q96GA3 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
LTV1Q96GA3 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
LTV1Q96GA3 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
LTV1Q96GA3 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
LTV1Q96GA3 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
LTV1Q96GA3 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
LTV1Q96GA3 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
LTV1Q96GA3 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
LTV1Q96GA3 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
LTV1Q96GA3 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
LTV1Q96GA3 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
LTV1Q96GA3 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
LTV1Q96GA3 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
LTV1Q96GA3 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
LTV1Q96GA3 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
LTV1Q96GA3 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
LTV1Q96GA3 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
LTV1Q96GA3 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
LTV1Q96GA3 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
LTV1Q96GA3 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
LTV1Q96GA3 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
LTV1Q96GA3 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
LTV1Q96GA3 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
LTV1Q96GA3 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
LTV1Q96GA3 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
LTV1Q96GA3 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC28.82■■■□□ 2.2
LTV1Q96GA3 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
LTV1Q96GA3 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
LTV1Q96GA3 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
LTV1Q96GA3 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
LTV1Q96GA3 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
LTV1Q96GA3 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
LTV1Q96GA3 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
LTV1Q96GA3 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
LTV1Q96GA3 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms