Protein–RNA interactions for Protein: Q96EU6

RRP36, Ribosomal RNA processing protein 36 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP36Q96EU6 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RRP36Q96EU6 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RRP36Q96EU6 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RRP36Q96EU6 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RRP36Q96EU6 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RRP36Q96EU6 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RRP36Q96EU6 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RRP36Q96EU6 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RRP36Q96EU6 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RRP36Q96EU6 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RRP36Q96EU6 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RRP36Q96EU6 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RRP36Q96EU6 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RRP36Q96EU6 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RRP36Q96EU6 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RRP36Q96EU6 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RRP36Q96EU6 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RRP36Q96EU6 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RRP36Q96EU6 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RRP36Q96EU6 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RRP36Q96EU6 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RRP36Q96EU6 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RRP36Q96EU6 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RRP36Q96EU6 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RRP36Q96EU6 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RRP36Q96EU6 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RRP36Q96EU6 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RRP36Q96EU6 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RRP36Q96EU6 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RRP36Q96EU6 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RRP36Q96EU6 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RRP36Q96EU6 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RRP36Q96EU6 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RRP36Q96EU6 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RRP36Q96EU6 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RRP36Q96EU6 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RRP36Q96EU6 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RRP36Q96EU6 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RRP36Q96EU6 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RRP36Q96EU6 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RRP36Q96EU6 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RRP36Q96EU6 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RRP36Q96EU6 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
RRP36Q96EU6 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RRP36Q96EU6 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RRP36Q96EU6 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RRP36Q96EU6 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
RRP36Q96EU6 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RRP36Q96EU6 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RRP36Q96EU6 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RRP36Q96EU6 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RRP36Q96EU6 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
RRP36Q96EU6 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
RRP36Q96EU6 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RRP36Q96EU6 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RRP36Q96EU6 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RRP36Q96EU6 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RRP36Q96EU6 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
RRP36Q96EU6 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RRP36Q96EU6 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RRP36Q96EU6 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RRP36Q96EU6 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
RRP36Q96EU6 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RRP36Q96EU6 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RRP36Q96EU6 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RRP36Q96EU6 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
RRP36Q96EU6 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RRP36Q96EU6 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RRP36Q96EU6 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RRP36Q96EU6 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RRP36Q96EU6 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RRP36Q96EU6 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RRP36Q96EU6 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RRP36Q96EU6 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RRP36Q96EU6 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RRP36Q96EU6 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RRP36Q96EU6 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RRP36Q96EU6 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RRP36Q96EU6 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RRP36Q96EU6 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RRP36Q96EU6 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RRP36Q96EU6 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RRP36Q96EU6 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RRP36Q96EU6 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RRP36Q96EU6 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RRP36Q96EU6 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RRP36Q96EU6 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
RRP36Q96EU6 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RRP36Q96EU6 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RRP36Q96EU6 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RRP36Q96EU6 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RRP36Q96EU6 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RRP36Q96EU6 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RRP36Q96EU6 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RRP36Q96EU6 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RRP36Q96EU6 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RRP36Q96EU6 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RRP36Q96EU6 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
RRP36Q96EU6 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
RRP36Q96EU6 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms