Protein–RNA interactions for Protein: Q96EA4

SPDL1, Protein Spindly, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPDL1Q96EA4 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SPDL1Q96EA4 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SPDL1Q96EA4 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SPDL1Q96EA4 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SPDL1Q96EA4 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SPDL1Q96EA4 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SPDL1Q96EA4 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SPDL1Q96EA4 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SPDL1Q96EA4 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
SPDL1Q96EA4 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SPDL1Q96EA4 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SPDL1Q96EA4 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SPDL1Q96EA4 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SPDL1Q96EA4 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SPDL1Q96EA4 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SPDL1Q96EA4 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SPDL1Q96EA4 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SPDL1Q96EA4 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SPDL1Q96EA4 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SPDL1Q96EA4 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SPDL1Q96EA4 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SPDL1Q96EA4 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SPDL1Q96EA4 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SPDL1Q96EA4 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SPDL1Q96EA4 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SPDL1Q96EA4 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SPDL1Q96EA4 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SPDL1Q96EA4 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SPDL1Q96EA4 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SPDL1Q96EA4 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SPDL1Q96EA4 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SPDL1Q96EA4 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SPDL1Q96EA4 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SPDL1Q96EA4 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SPDL1Q96EA4 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SPDL1Q96EA4 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SPDL1Q96EA4 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SPDL1Q96EA4 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SPDL1Q96EA4 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SPDL1Q96EA4 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SPDL1Q96EA4 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SPDL1Q96EA4 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SPDL1Q96EA4 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SPDL1Q96EA4 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SPDL1Q96EA4 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SPDL1Q96EA4 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SPDL1Q96EA4 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SPDL1Q96EA4 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SPDL1Q96EA4 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SPDL1Q96EA4 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SPDL1Q96EA4 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SPDL1Q96EA4 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SPDL1Q96EA4 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SPDL1Q96EA4 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SPDL1Q96EA4 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SPDL1Q96EA4 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SPDL1Q96EA4 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
SPDL1Q96EA4 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
SPDL1Q96EA4 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SPDL1Q96EA4 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SPDL1Q96EA4 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SPDL1Q96EA4 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPDL1Q96EA4 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPDL1Q96EA4 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPDL1Q96EA4 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPDL1Q96EA4 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPDL1Q96EA4 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPDL1Q96EA4 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPDL1Q96EA4 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPDL1Q96EA4 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SPDL1Q96EA4 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPDL1Q96EA4 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPDL1Q96EA4 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPDL1Q96EA4 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPDL1Q96EA4 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SPDL1Q96EA4 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SPDL1Q96EA4 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SPDL1Q96EA4 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SPDL1Q96EA4 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SPDL1Q96EA4 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SPDL1Q96EA4 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SPDL1Q96EA4 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SPDL1Q96EA4 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SPDL1Q96EA4 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SPDL1Q96EA4 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SPDL1Q96EA4 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SPDL1Q96EA4 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SPDL1Q96EA4 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SPDL1Q96EA4 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SPDL1Q96EA4 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SPDL1Q96EA4 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SPDL1Q96EA4 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SPDL1Q96EA4 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SPDL1Q96EA4 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SPDL1Q96EA4 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SPDL1Q96EA4 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SPDL1Q96EA4 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SPDL1Q96EA4 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SPDL1Q96EA4 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPDL1Q96EA4 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms