Protein–RNA interactions for Protein: Q92994

BRF1, Transcription factor IIIB 90 kDa subunit, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRF1Q92994 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
BRF1Q92994 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
BRF1Q92994 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
BRF1Q92994 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
BRF1Q92994 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
BRF1Q92994 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
BRF1Q92994 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
BRF1Q92994 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
BRF1Q92994 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
BRF1Q92994 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
BRF1Q92994 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
BRF1Q92994 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
BRF1Q92994 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
BRF1Q92994 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
BRF1Q92994 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
BRF1Q92994 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
BRF1Q92994 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
BRF1Q92994 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
BRF1Q92994 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
BRF1Q92994 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
BRF1Q92994 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
BRF1Q92994 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
BRF1Q92994 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
BRF1Q92994 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
BRF1Q92994 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BRF1Q92994 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BRF1Q92994 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
BRF1Q92994 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BRF1Q92994 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
BRF1Q92994 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BRF1Q92994 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
BRF1Q92994 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
BRF1Q92994 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
BRF1Q92994 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BRF1Q92994 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BRF1Q92994 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
BRF1Q92994 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
BRF1Q92994 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
BRF1Q92994 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
BRF1Q92994 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
BRF1Q92994 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
BRF1Q92994 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
BRF1Q92994 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
BRF1Q92994 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
BRF1Q92994 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
BRF1Q92994 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
BRF1Q92994 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
BRF1Q92994 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
BRF1Q92994 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
BRF1Q92994 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
BRF1Q92994 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
BRF1Q92994 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
BRF1Q92994 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
BRF1Q92994 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
BRF1Q92994 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
BRF1Q92994 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
BRF1Q92994 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
BRF1Q92994 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
BRF1Q92994 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
BRF1Q92994 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
BRF1Q92994 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
BRF1Q92994 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
BRF1Q92994 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
BRF1Q92994 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
BRF1Q92994 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
BRF1Q92994 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
BRF1Q92994 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
BRF1Q92994 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
BRF1Q92994 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
BRF1Q92994 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
BRF1Q92994 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
BRF1Q92994 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
BRF1Q92994 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BRF1Q92994 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BRF1Q92994 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BRF1Q92994 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BRF1Q92994 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
BRF1Q92994 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
BRF1Q92994 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
BRF1Q92994 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BRF1Q92994 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BRF1Q92994 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BRF1Q92994 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BRF1Q92994 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
BRF1Q92994 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
BRF1Q92994 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
BRF1Q92994 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
BRF1Q92994 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
BRF1Q92994 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
BRF1Q92994 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
BRF1Q92994 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
BRF1Q92994 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
BRF1Q92994 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
BRF1Q92994 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
BRF1Q92994 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
BRF1Q92994 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
BRF1Q92994 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
BRF1Q92994 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
BRF1Q92994 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
BRF1Q92994 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms