Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW27

APOBEC4, Putative C->U-editing enzyme APOBEC-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC4Q8WW27 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
APOBEC4Q8WW27 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
APOBEC4Q8WW27 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
APOBEC4Q8WW27 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
APOBEC4Q8WW27 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
APOBEC4Q8WW27 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
APOBEC4Q8WW27 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
APOBEC4Q8WW27 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
APOBEC4Q8WW27 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
APOBEC4Q8WW27 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
APOBEC4Q8WW27 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
APOBEC4Q8WW27 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
APOBEC4Q8WW27 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
APOBEC4Q8WW27 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
APOBEC4Q8WW27 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
APOBEC4Q8WW27 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
APOBEC4Q8WW27 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
APOBEC4Q8WW27 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
APOBEC4Q8WW27 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
APOBEC4Q8WW27 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
APOBEC4Q8WW27 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
APOBEC4Q8WW27 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
APOBEC4Q8WW27 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
APOBEC4Q8WW27 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
APOBEC4Q8WW27 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
APOBEC4Q8WW27 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
APOBEC4Q8WW27 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
APOBEC4Q8WW27 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
APOBEC4Q8WW27 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
APOBEC4Q8WW27 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
APOBEC4Q8WW27 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
APOBEC4Q8WW27 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
APOBEC4Q8WW27 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
APOBEC4Q8WW27 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
APOBEC4Q8WW27 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
APOBEC4Q8WW27 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
APOBEC4Q8WW27 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
APOBEC4Q8WW27 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
APOBEC4Q8WW27 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
APOBEC4Q8WW27 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
APOBEC4Q8WW27 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
APOBEC4Q8WW27 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
APOBEC4Q8WW27 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC20.64■□□□□ 0.89
APOBEC4Q8WW27 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
APOBEC4Q8WW27 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
APOBEC4Q8WW27 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
APOBEC4Q8WW27 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
APOBEC4Q8WW27 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
APOBEC4Q8WW27 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
APOBEC4Q8WW27 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
APOBEC4Q8WW27 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
APOBEC4Q8WW27 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
APOBEC4Q8WW27 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
APOBEC4Q8WW27 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
APOBEC4Q8WW27 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
APOBEC4Q8WW27 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
APOBEC4Q8WW27 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
APOBEC4Q8WW27 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
APOBEC4Q8WW27 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
APOBEC4Q8WW27 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
APOBEC4Q8WW27 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
APOBEC4Q8WW27 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
APOBEC4Q8WW27 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
APOBEC4Q8WW27 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
APOBEC4Q8WW27 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
APOBEC4Q8WW27 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
APOBEC4Q8WW27 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
APOBEC4Q8WW27 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
APOBEC4Q8WW27 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
APOBEC4Q8WW27 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
APOBEC4Q8WW27 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
APOBEC4Q8WW27 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
APOBEC4Q8WW27 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
APOBEC4Q8WW27 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
APOBEC4Q8WW27 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
APOBEC4Q8WW27 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
APOBEC4Q8WW27 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
APOBEC4Q8WW27 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
APOBEC4Q8WW27 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
APOBEC4Q8WW27 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
APOBEC4Q8WW27 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
APOBEC4Q8WW27 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
APOBEC4Q8WW27 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
APOBEC4Q8WW27 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
APOBEC4Q8WW27 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
APOBEC4Q8WW27 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
APOBEC4Q8WW27 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
APOBEC4Q8WW27 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
APOBEC4Q8WW27 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
APOBEC4Q8WW27 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
APOBEC4Q8WW27 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
APOBEC4Q8WW27 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
APOBEC4Q8WW27 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
APOBEC4Q8WW27 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
APOBEC4Q8WW27 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
APOBEC4Q8WW27 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
APOBEC4Q8WW27 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
APOBEC4Q8WW27 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
APOBEC4Q8WW27 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
APOBEC4Q8WW27 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms