Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV48

CCDC107, Coiled-coil domain-containing protein 107, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC107Q8WV48 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC107Q8WV48 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC107Q8WV48 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC107Q8WV48 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC107Q8WV48 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC107Q8WV48 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC107Q8WV48 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC107Q8WV48 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC107Q8WV48 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC107Q8WV48 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC107Q8WV48 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC107Q8WV48 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC107Q8WV48 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC107Q8WV48 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC107Q8WV48 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC107Q8WV48 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC107Q8WV48 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC107Q8WV48 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC107Q8WV48 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC107Q8WV48 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC107Q8WV48 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC107Q8WV48 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC107Q8WV48 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC107Q8WV48 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC107Q8WV48 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC107Q8WV48 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC107Q8WV48 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC107Q8WV48 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC107Q8WV48 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC107Q8WV48 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC107Q8WV48 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC107Q8WV48 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC107Q8WV48 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC107Q8WV48 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC107Q8WV48 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC107Q8WV48 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC107Q8WV48 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC107Q8WV48 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC107Q8WV48 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC107Q8WV48 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC107Q8WV48 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC107Q8WV48 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC107Q8WV48 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC107Q8WV48 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC107Q8WV48 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC107Q8WV48 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC107Q8WV48 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC107Q8WV48 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC107Q8WV48 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC107Q8WV48 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC107Q8WV48 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC107Q8WV48 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC107Q8WV48 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC107Q8WV48 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC107Q8WV48 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC107Q8WV48 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC107Q8WV48 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC107Q8WV48 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC107Q8WV48 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC107Q8WV48 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC107Q8WV48 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC107Q8WV48 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC107Q8WV48 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC107Q8WV48 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC107Q8WV48 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC107Q8WV48 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC107Q8WV48 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC107Q8WV48 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC107Q8WV48 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC107Q8WV48 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC107Q8WV48 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC107Q8WV48 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC107Q8WV48 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC107Q8WV48 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC107Q8WV48 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC107Q8WV48 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC107Q8WV48 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC107Q8WV48 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC107Q8WV48 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC107Q8WV48 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC107Q8WV48 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC107Q8WV48 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC107Q8WV48 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC107Q8WV48 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC107Q8WV48 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC107Q8WV48 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC107Q8WV48 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC107Q8WV48 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC107Q8WV48 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC107Q8WV48 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC107Q8WV48 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC107Q8WV48 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC107Q8WV48 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC107Q8WV48 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC107Q8WV48 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC107Q8WV48 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC107Q8WV48 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC107Q8WV48 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC107Q8WV48 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC107Q8WV48 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms