Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV19

SFT2D1, Vesicle transport protein SFT2A, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D1Q8WV19 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SFT2D1Q8WV19 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SFT2D1Q8WV19 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SFT2D1Q8WV19 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SFT2D1Q8WV19 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SFT2D1Q8WV19 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SFT2D1Q8WV19 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SFT2D1Q8WV19 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SFT2D1Q8WV19 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SFT2D1Q8WV19 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SFT2D1Q8WV19 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SFT2D1Q8WV19 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SFT2D1Q8WV19 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SFT2D1Q8WV19 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SFT2D1Q8WV19 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SFT2D1Q8WV19 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SFT2D1Q8WV19 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SFT2D1Q8WV19 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SFT2D1Q8WV19 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SFT2D1Q8WV19 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SFT2D1Q8WV19 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SFT2D1Q8WV19 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SFT2D1Q8WV19 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SFT2D1Q8WV19 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SFT2D1Q8WV19 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SFT2D1Q8WV19 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SFT2D1Q8WV19 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SFT2D1Q8WV19 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SFT2D1Q8WV19 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SFT2D1Q8WV19 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SFT2D1Q8WV19 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SFT2D1Q8WV19 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SFT2D1Q8WV19 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SFT2D1Q8WV19 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SFT2D1Q8WV19 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SFT2D1Q8WV19 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SFT2D1Q8WV19 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SFT2D1Q8WV19 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SFT2D1Q8WV19 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SFT2D1Q8WV19 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SFT2D1Q8WV19 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SFT2D1Q8WV19 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SFT2D1Q8WV19 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SFT2D1Q8WV19 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SFT2D1Q8WV19 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SFT2D1Q8WV19 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SFT2D1Q8WV19 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SFT2D1Q8WV19 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SFT2D1Q8WV19 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SFT2D1Q8WV19 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SFT2D1Q8WV19 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SFT2D1Q8WV19 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SFT2D1Q8WV19 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SFT2D1Q8WV19 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SFT2D1Q8WV19 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SFT2D1Q8WV19 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SFT2D1Q8WV19 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SFT2D1Q8WV19 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SFT2D1Q8WV19 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SFT2D1Q8WV19 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SFT2D1Q8WV19 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SFT2D1Q8WV19 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SFT2D1Q8WV19 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SFT2D1Q8WV19 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SFT2D1Q8WV19 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SFT2D1Q8WV19 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SFT2D1Q8WV19 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SFT2D1Q8WV19 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SFT2D1Q8WV19 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SFT2D1Q8WV19 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SFT2D1Q8WV19 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SFT2D1Q8WV19 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SFT2D1Q8WV19 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SFT2D1Q8WV19 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SFT2D1Q8WV19 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SFT2D1Q8WV19 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SFT2D1Q8WV19 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SFT2D1Q8WV19 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SFT2D1Q8WV19 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SFT2D1Q8WV19 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SFT2D1Q8WV19 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SFT2D1Q8WV19 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SFT2D1Q8WV19 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SFT2D1Q8WV19 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SFT2D1Q8WV19 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SFT2D1Q8WV19 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SFT2D1Q8WV19 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SFT2D1Q8WV19 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SFT2D1Q8WV19 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SFT2D1Q8WV19 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SFT2D1Q8WV19 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SFT2D1Q8WV19 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SFT2D1Q8WV19 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SFT2D1Q8WV19 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SFT2D1Q8WV19 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SFT2D1Q8WV19 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SFT2D1Q8WV19 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SFT2D1Q8WV19 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SFT2D1Q8WV19 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SFT2D1Q8WV19 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms