Protein–RNA interactions for Protein: Q8TC56

FAM71B, Protein FAM71B, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM71BQ8TC56 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FAM71BQ8TC56 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FAM71BQ8TC56 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FAM71BQ8TC56 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FAM71BQ8TC56 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FAM71BQ8TC56 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FAM71BQ8TC56 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FAM71BQ8TC56 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FAM71BQ8TC56 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FAM71BQ8TC56 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FAM71BQ8TC56 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FAM71BQ8TC56 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
FAM71BQ8TC56 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
FAM71BQ8TC56 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FAM71BQ8TC56 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FAM71BQ8TC56 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FAM71BQ8TC56 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FAM71BQ8TC56 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
FAM71BQ8TC56 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FAM71BQ8TC56 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FAM71BQ8TC56 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FAM71BQ8TC56 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FAM71BQ8TC56 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FAM71BQ8TC56 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
FAM71BQ8TC56 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
FAM71BQ8TC56 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FAM71BQ8TC56 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FAM71BQ8TC56 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FAM71BQ8TC56 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FAM71BQ8TC56 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FAM71BQ8TC56 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FAM71BQ8TC56 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FAM71BQ8TC56 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FAM71BQ8TC56 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FAM71BQ8TC56 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FAM71BQ8TC56 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FAM71BQ8TC56 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
FAM71BQ8TC56 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FAM71BQ8TC56 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FAM71BQ8TC56 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FAM71BQ8TC56 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FAM71BQ8TC56 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FAM71BQ8TC56 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
FAM71BQ8TC56 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FAM71BQ8TC56 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FAM71BQ8TC56 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FAM71BQ8TC56 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FAM71BQ8TC56 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FAM71BQ8TC56 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FAM71BQ8TC56 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FAM71BQ8TC56 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FAM71BQ8TC56 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
FAM71BQ8TC56 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FAM71BQ8TC56 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FAM71BQ8TC56 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FAM71BQ8TC56 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FAM71BQ8TC56 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
FAM71BQ8TC56 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FAM71BQ8TC56 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FAM71BQ8TC56 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FAM71BQ8TC56 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FAM71BQ8TC56 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
FAM71BQ8TC56 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
FAM71BQ8TC56 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
FAM71BQ8TC56 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FAM71BQ8TC56 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FAM71BQ8TC56 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FAM71BQ8TC56 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FAM71BQ8TC56 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FAM71BQ8TC56 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FAM71BQ8TC56 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FAM71BQ8TC56 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FAM71BQ8TC56 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FAM71BQ8TC56 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FAM71BQ8TC56 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FAM71BQ8TC56 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FAM71BQ8TC56 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FAM71BQ8TC56 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FAM71BQ8TC56 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FAM71BQ8TC56 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FAM71BQ8TC56 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FAM71BQ8TC56 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FAM71BQ8TC56 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FAM71BQ8TC56 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FAM71BQ8TC56 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FAM71BQ8TC56 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FAM71BQ8TC56 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FAM71BQ8TC56 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FAM71BQ8TC56 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
FAM71BQ8TC56 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FAM71BQ8TC56 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FAM71BQ8TC56 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FAM71BQ8TC56 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FAM71BQ8TC56 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FAM71BQ8TC56 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FAM71BQ8TC56 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FAM71BQ8TC56 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FAM71BQ8TC56 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FAM71BQ8TC56 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FAM71BQ8TC56 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms