Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND24

RNF214, RING finger protein 214, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF214Q8ND24 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RNF214Q8ND24 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RNF214Q8ND24 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RNF214Q8ND24 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RNF214Q8ND24 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RNF214Q8ND24 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RNF214Q8ND24 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RNF214Q8ND24 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RNF214Q8ND24 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RNF214Q8ND24 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RNF214Q8ND24 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RNF214Q8ND24 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RNF214Q8ND24 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RNF214Q8ND24 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RNF214Q8ND24 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RNF214Q8ND24 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RNF214Q8ND24 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RNF214Q8ND24 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RNF214Q8ND24 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RNF214Q8ND24 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RNF214Q8ND24 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RNF214Q8ND24 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
RNF214Q8ND24 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RNF214Q8ND24 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RNF214Q8ND24 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RNF214Q8ND24 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RNF214Q8ND24 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RNF214Q8ND24 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RNF214Q8ND24 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RNF214Q8ND24 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RNF214Q8ND24 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RNF214Q8ND24 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RNF214Q8ND24 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RNF214Q8ND24 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RNF214Q8ND24 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
RNF214Q8ND24 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RNF214Q8ND24 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RNF214Q8ND24 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
RNF214Q8ND24 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RNF214Q8ND24 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RNF214Q8ND24 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RNF214Q8ND24 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RNF214Q8ND24 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RNF214Q8ND24 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RNF214Q8ND24 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RNF214Q8ND24 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RNF214Q8ND24 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RNF214Q8ND24 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RNF214Q8ND24 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RNF214Q8ND24 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RNF214Q8ND24 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RNF214Q8ND24 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RNF214Q8ND24 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RNF214Q8ND24 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RNF214Q8ND24 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RNF214Q8ND24 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RNF214Q8ND24 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RNF214Q8ND24 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RNF214Q8ND24 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RNF214Q8ND24 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RNF214Q8ND24 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RNF214Q8ND24 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RNF214Q8ND24 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RNF214Q8ND24 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
RNF214Q8ND24 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RNF214Q8ND24 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RNF214Q8ND24 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RNF214Q8ND24 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RNF214Q8ND24 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RNF214Q8ND24 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RNF214Q8ND24 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RNF214Q8ND24 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RNF214Q8ND24 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RNF214Q8ND24 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RNF214Q8ND24 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RNF214Q8ND24 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RNF214Q8ND24 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RNF214Q8ND24 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RNF214Q8ND24 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RNF214Q8ND24 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RNF214Q8ND24 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RNF214Q8ND24 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
RNF214Q8ND24 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RNF214Q8ND24 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RNF214Q8ND24 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RNF214Q8ND24 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RNF214Q8ND24 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RNF214Q8ND24 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RNF214Q8ND24 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RNF214Q8ND24 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
RNF214Q8ND24 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RNF214Q8ND24 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RNF214Q8ND24 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RNF214Q8ND24 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RNF214Q8ND24 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RNF214Q8ND24 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RNF214Q8ND24 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RNF214Q8ND24 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RNF214Q8ND24 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
RNF214Q8ND24 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms