Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCT1

ARRDC4, Arrestin domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARRDC4Q8NCT1 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ARRDC4Q8NCT1 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ARRDC4Q8NCT1 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
ARRDC4Q8NCT1 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ARRDC4Q8NCT1 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ARRDC4Q8NCT1 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ARRDC4Q8NCT1 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ARRDC4Q8NCT1 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ARRDC4Q8NCT1 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARRDC4Q8NCT1 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARRDC4Q8NCT1 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARRDC4Q8NCT1 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARRDC4Q8NCT1 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARRDC4Q8NCT1 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
ARRDC4Q8NCT1 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARRDC4Q8NCT1 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARRDC4Q8NCT1 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARRDC4Q8NCT1 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARRDC4Q8NCT1 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ARRDC4Q8NCT1 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ARRDC4Q8NCT1 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ARRDC4Q8NCT1 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
ARRDC4Q8NCT1 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ARRDC4Q8NCT1 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ARRDC4Q8NCT1 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
ARRDC4Q8NCT1 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
ARRDC4Q8NCT1 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ARRDC4Q8NCT1 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ARRDC4Q8NCT1 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ARRDC4Q8NCT1 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ARRDC4Q8NCT1 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ARRDC4Q8NCT1 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARRDC4Q8NCT1 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARRDC4Q8NCT1 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARRDC4Q8NCT1 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARRDC4Q8NCT1 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARRDC4Q8NCT1 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARRDC4Q8NCT1 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARRDC4Q8NCT1 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
ARRDC4Q8NCT1 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARRDC4Q8NCT1 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARRDC4Q8NCT1 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARRDC4Q8NCT1 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARRDC4Q8NCT1 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARRDC4Q8NCT1 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARRDC4Q8NCT1 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARRDC4Q8NCT1 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARRDC4Q8NCT1 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARRDC4Q8NCT1 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARRDC4Q8NCT1 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARRDC4Q8NCT1 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARRDC4Q8NCT1 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARRDC4Q8NCT1 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARRDC4Q8NCT1 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARRDC4Q8NCT1 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ARRDC4Q8NCT1 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARRDC4Q8NCT1 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARRDC4Q8NCT1 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARRDC4Q8NCT1 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARRDC4Q8NCT1 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ARRDC4Q8NCT1 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ARRDC4Q8NCT1 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
ARRDC4Q8NCT1 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ARRDC4Q8NCT1 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ARRDC4Q8NCT1 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ARRDC4Q8NCT1 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ARRDC4Q8NCT1 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ARRDC4Q8NCT1 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARRDC4Q8NCT1 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARRDC4Q8NCT1 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ARRDC4Q8NCT1 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARRDC4Q8NCT1 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARRDC4Q8NCT1 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARRDC4Q8NCT1 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARRDC4Q8NCT1 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARRDC4Q8NCT1 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARRDC4Q8NCT1 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARRDC4Q8NCT1 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARRDC4Q8NCT1 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARRDC4Q8NCT1 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARRDC4Q8NCT1 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARRDC4Q8NCT1 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARRDC4Q8NCT1 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ARRDC4Q8NCT1 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARRDC4Q8NCT1 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARRDC4Q8NCT1 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARRDC4Q8NCT1 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARRDC4Q8NCT1 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARRDC4Q8NCT1 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARRDC4Q8NCT1 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARRDC4Q8NCT1 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARRDC4Q8NCT1 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARRDC4Q8NCT1 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARRDC4Q8NCT1 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARRDC4Q8NCT1 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
ARRDC4Q8NCT1 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
ARRDC4Q8NCT1 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARRDC4Q8NCT1 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARRDC4Q8NCT1 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARRDC4Q8NCT1 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms