Protein–RNA interactions for Protein: Q8NAA4

ATG16L2, Autophagy-related protein 16-2, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L2Q8NAA4 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATG16L2Q8NAA4 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATG16L2Q8NAA4 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATG16L2Q8NAA4 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATG16L2Q8NAA4 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATG16L2Q8NAA4 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATG16L2Q8NAA4 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATG16L2Q8NAA4 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
ATG16L2Q8NAA4 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATG16L2Q8NAA4 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
ATG16L2Q8NAA4 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ATG16L2Q8NAA4 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
ATG16L2Q8NAA4 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATG16L2Q8NAA4 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATG16L2Q8NAA4 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATG16L2Q8NAA4 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATG16L2Q8NAA4 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATG16L2Q8NAA4 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATG16L2Q8NAA4 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATG16L2Q8NAA4 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATG16L2Q8NAA4 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATG16L2Q8NAA4 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATG16L2Q8NAA4 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATG16L2Q8NAA4 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATG16L2Q8NAA4 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATG16L2Q8NAA4 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATG16L2Q8NAA4 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ATG16L2Q8NAA4 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ATG16L2Q8NAA4 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ATG16L2Q8NAA4 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATG16L2Q8NAA4 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC20■□□□□ 0.79
ATG16L2Q8NAA4 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC20■□□□□ 0.79
ATG16L2Q8NAA4 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATG16L2Q8NAA4 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ATG16L2Q8NAA4 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ATG16L2Q8NAA4 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATG16L2Q8NAA4 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATG16L2Q8NAA4 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATG16L2Q8NAA4 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATG16L2Q8NAA4 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC20■□□□□ 0.79
ATG16L2Q8NAA4 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATG16L2Q8NAA4 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATG16L2Q8NAA4 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATG16L2Q8NAA4 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATG16L2Q8NAA4 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATG16L2Q8NAA4 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATG16L2Q8NAA4 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATG16L2Q8NAA4 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATG16L2Q8NAA4 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATG16L2Q8NAA4 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATG16L2Q8NAA4 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATG16L2Q8NAA4 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATG16L2Q8NAA4 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATG16L2Q8NAA4 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATG16L2Q8NAA4 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATG16L2Q8NAA4 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
ATG16L2Q8NAA4 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
ATG16L2Q8NAA4 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATG16L2Q8NAA4 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATG16L2Q8NAA4 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATG16L2Q8NAA4 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATG16L2Q8NAA4 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATG16L2Q8NAA4 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATG16L2Q8NAA4 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATG16L2Q8NAA4 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATG16L2Q8NAA4 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
ATG16L2Q8NAA4 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATG16L2Q8NAA4 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
ATG16L2Q8NAA4 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATG16L2Q8NAA4 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATG16L2Q8NAA4 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATG16L2Q8NAA4 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATG16L2Q8NAA4 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATG16L2Q8NAA4 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATG16L2Q8NAA4 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATG16L2Q8NAA4 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATG16L2Q8NAA4 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATG16L2Q8NAA4 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATG16L2Q8NAA4 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATG16L2Q8NAA4 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATG16L2Q8NAA4 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATG16L2Q8NAA4 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATG16L2Q8NAA4 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATG16L2Q8NAA4 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATG16L2Q8NAA4 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATG16L2Q8NAA4 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATG16L2Q8NAA4 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATG16L2Q8NAA4 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATG16L2Q8NAA4 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATG16L2Q8NAA4 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATG16L2Q8NAA4 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATG16L2Q8NAA4 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATG16L2Q8NAA4 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATG16L2Q8NAA4 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATG16L2Q8NAA4 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATG16L2Q8NAA4 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATG16L2Q8NAA4 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATG16L2Q8NAA4 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATG16L2Q8NAA4 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATG16L2Q8NAA4 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms