Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA47

CCDC63, Coiled-coil domain-containing protein 63, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC63Q8NA47 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC63Q8NA47 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC63Q8NA47 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC63Q8NA47 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC63Q8NA47 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC63Q8NA47 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC63Q8NA47 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC63Q8NA47 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC63Q8NA47 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC63Q8NA47 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC63Q8NA47 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC63Q8NA47 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC63Q8NA47 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC63Q8NA47 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC63Q8NA47 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC63Q8NA47 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC63Q8NA47 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC63Q8NA47 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC63Q8NA47 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC63Q8NA47 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC63Q8NA47 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC63Q8NA47 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC63Q8NA47 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC63Q8NA47 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC63Q8NA47 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC63Q8NA47 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC63Q8NA47 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC63Q8NA47 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC63Q8NA47 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC63Q8NA47 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC63Q8NA47 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC63Q8NA47 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC63Q8NA47 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC63Q8NA47 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC63Q8NA47 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC63Q8NA47 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC63Q8NA47 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC63Q8NA47 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC63Q8NA47 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC63Q8NA47 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC63Q8NA47 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC63Q8NA47 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC63Q8NA47 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC63Q8NA47 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC63Q8NA47 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC63Q8NA47 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC63Q8NA47 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC63Q8NA47 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC63Q8NA47 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC63Q8NA47 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC63Q8NA47 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC63Q8NA47 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC63Q8NA47 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC63Q8NA47 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC63Q8NA47 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC63Q8NA47 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC63Q8NA47 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC63Q8NA47 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC63Q8NA47 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC63Q8NA47 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC63Q8NA47 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC63Q8NA47 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC63Q8NA47 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC63Q8NA47 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC63Q8NA47 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC63Q8NA47 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC63Q8NA47 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC63Q8NA47 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC63Q8NA47 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC63Q8NA47 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC63Q8NA47 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC63Q8NA47 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC63Q8NA47 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC63Q8NA47 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC63Q8NA47 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC63Q8NA47 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC63Q8NA47 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC63Q8NA47 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC63Q8NA47 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
CCDC63Q8NA47 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.07
CCDC63Q8NA47 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
CCDC63Q8NA47 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC63Q8NA47 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC63Q8NA47 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC63Q8NA47 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC63Q8NA47 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC63Q8NA47 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC63Q8NA47 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC63Q8NA47 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC63Q8NA47 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC63Q8NA47 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC63Q8NA47 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC63Q8NA47 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC63Q8NA47 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC63Q8NA47 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC63Q8NA47 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC63Q8NA47 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC63Q8NA47 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC63Q8NA47 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC63Q8NA47 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms