Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9W5

DNAAF3, Dynein assembly factor 3, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAAF3Q8N9W5 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DNAAF3Q8N9W5 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DNAAF3Q8N9W5 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DNAAF3Q8N9W5 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
DNAAF3Q8N9W5 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DNAAF3Q8N9W5 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DNAAF3Q8N9W5 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
DNAAF3Q8N9W5 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
DNAAF3Q8N9W5 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DNAAF3Q8N9W5 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DNAAF3Q8N9W5 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DNAAF3Q8N9W5 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DNAAF3Q8N9W5 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DNAAF3Q8N9W5 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DNAAF3Q8N9W5 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DNAAF3Q8N9W5 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DNAAF3Q8N9W5 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
DNAAF3Q8N9W5 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DNAAF3Q8N9W5 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DNAAF3Q8N9W5 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DNAAF3Q8N9W5 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DNAAF3Q8N9W5 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DNAAF3Q8N9W5 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DNAAF3Q8N9W5 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DNAAF3Q8N9W5 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DNAAF3Q8N9W5 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DNAAF3Q8N9W5 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DNAAF3Q8N9W5 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DNAAF3Q8N9W5 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DNAAF3Q8N9W5 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DNAAF3Q8N9W5 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DNAAF3Q8N9W5 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DNAAF3Q8N9W5 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DNAAF3Q8N9W5 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DNAAF3Q8N9W5 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DNAAF3Q8N9W5 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DNAAF3Q8N9W5 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DNAAF3Q8N9W5 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DNAAF3Q8N9W5 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DNAAF3Q8N9W5 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DNAAF3Q8N9W5 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
DNAAF3Q8N9W5 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
DNAAF3Q8N9W5 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
DNAAF3Q8N9W5 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DNAAF3Q8N9W5 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DNAAF3Q8N9W5 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DNAAF3Q8N9W5 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DNAAF3Q8N9W5 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DNAAF3Q8N9W5 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DNAAF3Q8N9W5 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DNAAF3Q8N9W5 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DNAAF3Q8N9W5 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DNAAF3Q8N9W5 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DNAAF3Q8N9W5 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DNAAF3Q8N9W5 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
DNAAF3Q8N9W5 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DNAAF3Q8N9W5 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DNAAF3Q8N9W5 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DNAAF3Q8N9W5 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DNAAF3Q8N9W5 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DNAAF3Q8N9W5 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DNAAF3Q8N9W5 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DNAAF3Q8N9W5 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
DNAAF3Q8N9W5 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DNAAF3Q8N9W5 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DNAAF3Q8N9W5 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
DNAAF3Q8N9W5 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DNAAF3Q8N9W5 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DNAAF3Q8N9W5 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DNAAF3Q8N9W5 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
DNAAF3Q8N9W5 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
DNAAF3Q8N9W5 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DNAAF3Q8N9W5 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
DNAAF3Q8N9W5 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DNAAF3Q8N9W5 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DNAAF3Q8N9W5 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DNAAF3Q8N9W5 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DNAAF3Q8N9W5 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
DNAAF3Q8N9W5 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
DNAAF3Q8N9W5 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DNAAF3Q8N9W5 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DNAAF3Q8N9W5 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DNAAF3Q8N9W5 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DNAAF3Q8N9W5 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
DNAAF3Q8N9W5 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DNAAF3Q8N9W5 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
DNAAF3Q8N9W5 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DNAAF3Q8N9W5 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DNAAF3Q8N9W5 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DNAAF3Q8N9W5 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DNAAF3Q8N9W5 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
DNAAF3Q8N9W5 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
DNAAF3Q8N9W5 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
DNAAF3Q8N9W5 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
DNAAF3Q8N9W5 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
DNAAF3Q8N9W5 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
DNAAF3Q8N9W5 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
DNAAF3Q8N9W5 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DNAAF3Q8N9W5 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DNAAF3Q8N9W5 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms