Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9U0

TC2N, Tandem C2 domains nuclear protein, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TC2NQ8N9U0 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TC2NQ8N9U0 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TC2NQ8N9U0 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TC2NQ8N9U0 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TC2NQ8N9U0 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TC2NQ8N9U0 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TC2NQ8N9U0 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TC2NQ8N9U0 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TC2NQ8N9U0 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TC2NQ8N9U0 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TC2NQ8N9U0 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TC2NQ8N9U0 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TC2NQ8N9U0 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TC2NQ8N9U0 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TC2NQ8N9U0 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TC2NQ8N9U0 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TC2NQ8N9U0 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TC2NQ8N9U0 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TC2NQ8N9U0 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TC2NQ8N9U0 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TC2NQ8N9U0 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TC2NQ8N9U0 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TC2NQ8N9U0 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TC2NQ8N9U0 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TC2NQ8N9U0 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TC2NQ8N9U0 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TC2NQ8N9U0 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TC2NQ8N9U0 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TC2NQ8N9U0 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TC2NQ8N9U0 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TC2NQ8N9U0 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TC2NQ8N9U0 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TC2NQ8N9U0 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TC2NQ8N9U0 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TC2NQ8N9U0 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TC2NQ8N9U0 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TC2NQ8N9U0 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TC2NQ8N9U0 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TC2NQ8N9U0 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TC2NQ8N9U0 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TC2NQ8N9U0 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TC2NQ8N9U0 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TC2NQ8N9U0 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TC2NQ8N9U0 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TC2NQ8N9U0 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TC2NQ8N9U0 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TC2NQ8N9U0 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TC2NQ8N9U0 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TC2NQ8N9U0 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TC2NQ8N9U0 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TC2NQ8N9U0 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TC2NQ8N9U0 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TC2NQ8N9U0 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TC2NQ8N9U0 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TC2NQ8N9U0 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TC2NQ8N9U0 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TC2NQ8N9U0 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TC2NQ8N9U0 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TC2NQ8N9U0 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TC2NQ8N9U0 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TC2NQ8N9U0 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TC2NQ8N9U0 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TC2NQ8N9U0 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TC2NQ8N9U0 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TC2NQ8N9U0 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TC2NQ8N9U0 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TC2NQ8N9U0 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TC2NQ8N9U0 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TC2NQ8N9U0 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TC2NQ8N9U0 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TC2NQ8N9U0 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TC2NQ8N9U0 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TC2NQ8N9U0 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TC2NQ8N9U0 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TC2NQ8N9U0 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TC2NQ8N9U0 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TC2NQ8N9U0 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TC2NQ8N9U0 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TC2NQ8N9U0 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TC2NQ8N9U0 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TC2NQ8N9U0 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TC2NQ8N9U0 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TC2NQ8N9U0 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TC2NQ8N9U0 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TC2NQ8N9U0 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TC2NQ8N9U0 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TC2NQ8N9U0 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TC2NQ8N9U0 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TC2NQ8N9U0 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TC2NQ8N9U0 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TC2NQ8N9U0 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
TC2NQ8N9U0 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TC2NQ8N9U0 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TC2NQ8N9U0 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TC2NQ8N9U0 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TC2NQ8N9U0 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TC2NQ8N9U0 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TC2NQ8N9U0 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TC2NQ8N9U0 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TC2NQ8N9U0 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms