Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6L0

CCDC155, Protein KASH5, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC155Q8N6L0 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC155Q8N6L0 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC155Q8N6L0 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC155Q8N6L0 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC155Q8N6L0 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC155Q8N6L0 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC155Q8N6L0 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC155Q8N6L0 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC155Q8N6L0 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC155Q8N6L0 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC155Q8N6L0 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC155Q8N6L0 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC155Q8N6L0 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC155Q8N6L0 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC155Q8N6L0 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC155Q8N6L0 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC155Q8N6L0 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC155Q8N6L0 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC155Q8N6L0 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC155Q8N6L0 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC155Q8N6L0 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC155Q8N6L0 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC155Q8N6L0 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC155Q8N6L0 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC155Q8N6L0 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC155Q8N6L0 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC155Q8N6L0 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC155Q8N6L0 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC155Q8N6L0 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC155Q8N6L0 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC155Q8N6L0 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC155Q8N6L0 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC155Q8N6L0 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC155Q8N6L0 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC155Q8N6L0 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC155Q8N6L0 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC155Q8N6L0 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC155Q8N6L0 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC155Q8N6L0 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC155Q8N6L0 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC155Q8N6L0 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC155Q8N6L0 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC155Q8N6L0 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC155Q8N6L0 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC155Q8N6L0 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC155Q8N6L0 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC155Q8N6L0 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC155Q8N6L0 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC155Q8N6L0 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC155Q8N6L0 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC155Q8N6L0 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC155Q8N6L0 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC155Q8N6L0 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC155Q8N6L0 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC155Q8N6L0 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC155Q8N6L0 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC155Q8N6L0 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC155Q8N6L0 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC155Q8N6L0 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC155Q8N6L0 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC155Q8N6L0 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC155Q8N6L0 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC155Q8N6L0 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC155Q8N6L0 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC155Q8N6L0 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC155Q8N6L0 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC155Q8N6L0 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC155Q8N6L0 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC155Q8N6L0 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC155Q8N6L0 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC155Q8N6L0 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC155Q8N6L0 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC155Q8N6L0 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC155Q8N6L0 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC155Q8N6L0 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC155Q8N6L0 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC155Q8N6L0 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC155Q8N6L0 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC155Q8N6L0 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC155Q8N6L0 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC155Q8N6L0 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC155Q8N6L0 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC155Q8N6L0 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC155Q8N6L0 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC155Q8N6L0 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC155Q8N6L0 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC155Q8N6L0 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC155Q8N6L0 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC155Q8N6L0 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC155Q8N6L0 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC155Q8N6L0 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC155Q8N6L0 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC155Q8N6L0 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC155Q8N6L0 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC155Q8N6L0 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC155Q8N6L0 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC155Q8N6L0 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC155Q8N6L0 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC155Q8N6L0 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC155Q8N6L0 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms