Protein–RNA interactions for Protein: Q8N394

TMTC2, Transmembrane and TPR repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMTC2Q8N394 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMTC2Q8N394 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMTC2Q8N394 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMTC2Q8N394 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMTC2Q8N394 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMTC2Q8N394 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMTC2Q8N394 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMTC2Q8N394 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMTC2Q8N394 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMTC2Q8N394 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMTC2Q8N394 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMTC2Q8N394 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMTC2Q8N394 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMTC2Q8N394 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMTC2Q8N394 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMTC2Q8N394 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMTC2Q8N394 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMTC2Q8N394 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMTC2Q8N394 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMTC2Q8N394 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMTC2Q8N394 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMTC2Q8N394 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMTC2Q8N394 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMTC2Q8N394 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMTC2Q8N394 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMTC2Q8N394 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMTC2Q8N394 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMTC2Q8N394 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMTC2Q8N394 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMTC2Q8N394 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
TMTC2Q8N394 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMTC2Q8N394 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMTC2Q8N394 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMTC2Q8N394 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMTC2Q8N394 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMTC2Q8N394 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMTC2Q8N394 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMTC2Q8N394 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMTC2Q8N394 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMTC2Q8N394 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMTC2Q8N394 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMTC2Q8N394 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMTC2Q8N394 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMTC2Q8N394 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMTC2Q8N394 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMTC2Q8N394 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMTC2Q8N394 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
TMTC2Q8N394 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMTC2Q8N394 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMTC2Q8N394 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMTC2Q8N394 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMTC2Q8N394 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMTC2Q8N394 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMTC2Q8N394 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMTC2Q8N394 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMTC2Q8N394 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMTC2Q8N394 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
TMTC2Q8N394 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMTC2Q8N394 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMTC2Q8N394 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMTC2Q8N394 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMTC2Q8N394 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMTC2Q8N394 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMTC2Q8N394 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMTC2Q8N394 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMTC2Q8N394 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMTC2Q8N394 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMTC2Q8N394 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMTC2Q8N394 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMTC2Q8N394 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMTC2Q8N394 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMTC2Q8N394 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMTC2Q8N394 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMTC2Q8N394 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMTC2Q8N394 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMTC2Q8N394 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
TMTC2Q8N394 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMTC2Q8N394 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMTC2Q8N394 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMTC2Q8N394 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMTC2Q8N394 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMTC2Q8N394 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMTC2Q8N394 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMTC2Q8N394 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMTC2Q8N394 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMTC2Q8N394 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMTC2Q8N394 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMTC2Q8N394 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
TMTC2Q8N394 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMTC2Q8N394 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMTC2Q8N394 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMTC2Q8N394 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMTC2Q8N394 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMTC2Q8N394 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMTC2Q8N394 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMTC2Q8N394 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMTC2Q8N394 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMTC2Q8N394 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMTC2Q8N394 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMTC2Q8N394 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms