Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z4S9

SH2D6, SH2 domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH2D6Q7Z4S9 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SH2D6Q7Z4S9 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SH2D6Q7Z4S9 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SH2D6Q7Z4S9 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SH2D6Q7Z4S9 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SH2D6Q7Z4S9 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SH2D6Q7Z4S9 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SH2D6Q7Z4S9 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SH2D6Q7Z4S9 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SH2D6Q7Z4S9 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SH2D6Q7Z4S9 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SH2D6Q7Z4S9 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SH2D6Q7Z4S9 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SH2D6Q7Z4S9 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SH2D6Q7Z4S9 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SH2D6Q7Z4S9 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SH2D6Q7Z4S9 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SH2D6Q7Z4S9 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SH2D6Q7Z4S9 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SH2D6Q7Z4S9 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SH2D6Q7Z4S9 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SH2D6Q7Z4S9 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SH2D6Q7Z4S9 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SH2D6Q7Z4S9 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SH2D6Q7Z4S9 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SH2D6Q7Z4S9 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SH2D6Q7Z4S9 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SH2D6Q7Z4S9 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SH2D6Q7Z4S9 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SH2D6Q7Z4S9 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SH2D6Q7Z4S9 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SH2D6Q7Z4S9 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SH2D6Q7Z4S9 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SH2D6Q7Z4S9 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SH2D6Q7Z4S9 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SH2D6Q7Z4S9 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SH2D6Q7Z4S9 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SH2D6Q7Z4S9 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SH2D6Q7Z4S9 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SH2D6Q7Z4S9 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SH2D6Q7Z4S9 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SH2D6Q7Z4S9 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SH2D6Q7Z4S9 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SH2D6Q7Z4S9 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SH2D6Q7Z4S9 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SH2D6Q7Z4S9 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SH2D6Q7Z4S9 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SH2D6Q7Z4S9 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SH2D6Q7Z4S9 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SH2D6Q7Z4S9 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SH2D6Q7Z4S9 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SH2D6Q7Z4S9 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SH2D6Q7Z4S9 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SH2D6Q7Z4S9 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SH2D6Q7Z4S9 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SH2D6Q7Z4S9 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SH2D6Q7Z4S9 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SH2D6Q7Z4S9 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SH2D6Q7Z4S9 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SH2D6Q7Z4S9 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SH2D6Q7Z4S9 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SH2D6Q7Z4S9 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SH2D6Q7Z4S9 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SH2D6Q7Z4S9 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SH2D6Q7Z4S9 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SH2D6Q7Z4S9 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SH2D6Q7Z4S9 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SH2D6Q7Z4S9 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SH2D6Q7Z4S9 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SH2D6Q7Z4S9 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SH2D6Q7Z4S9 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SH2D6Q7Z4S9 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SH2D6Q7Z4S9 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SH2D6Q7Z4S9 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SH2D6Q7Z4S9 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SH2D6Q7Z4S9 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SH2D6Q7Z4S9 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SH2D6Q7Z4S9 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SH2D6Q7Z4S9 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SH2D6Q7Z4S9 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SH2D6Q7Z4S9 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SH2D6Q7Z4S9 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SH2D6Q7Z4S9 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SH2D6Q7Z4S9 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SH2D6Q7Z4S9 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SH2D6Q7Z4S9 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SH2D6Q7Z4S9 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SH2D6Q7Z4S9 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SH2D6Q7Z4S9 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SH2D6Q7Z4S9 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SH2D6Q7Z4S9 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SH2D6Q7Z4S9 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SH2D6Q7Z4S9 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SH2D6Q7Z4S9 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SH2D6Q7Z4S9 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SH2D6Q7Z4S9 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SH2D6Q7Z4S9 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SH2D6Q7Z4S9 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SH2D6Q7Z4S9 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SH2D6Q7Z4S9 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms