Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z2E3

APTX, Aprataxin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APTXQ7Z2E3 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
APTXQ7Z2E3 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
APTXQ7Z2E3 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
APTXQ7Z2E3 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
APTXQ7Z2E3 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
APTXQ7Z2E3 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
APTXQ7Z2E3 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
APTXQ7Z2E3 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
APTXQ7Z2E3 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
APTXQ7Z2E3 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
APTXQ7Z2E3 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
APTXQ7Z2E3 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
APTXQ7Z2E3 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
APTXQ7Z2E3 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
APTXQ7Z2E3 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
APTXQ7Z2E3 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
APTXQ7Z2E3 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
APTXQ7Z2E3 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
APTXQ7Z2E3 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
APTXQ7Z2E3 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
APTXQ7Z2E3 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
APTXQ7Z2E3 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
APTXQ7Z2E3 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
APTXQ7Z2E3 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
APTXQ7Z2E3 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
APTXQ7Z2E3 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
APTXQ7Z2E3 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
APTXQ7Z2E3 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
APTXQ7Z2E3 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
APTXQ7Z2E3 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
APTXQ7Z2E3 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
APTXQ7Z2E3 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
APTXQ7Z2E3 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
APTXQ7Z2E3 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
APTXQ7Z2E3 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
APTXQ7Z2E3 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
APTXQ7Z2E3 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
APTXQ7Z2E3 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
APTXQ7Z2E3 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
APTXQ7Z2E3 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
APTXQ7Z2E3 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
APTXQ7Z2E3 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
APTXQ7Z2E3 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
APTXQ7Z2E3 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
APTXQ7Z2E3 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
APTXQ7Z2E3 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
APTXQ7Z2E3 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
APTXQ7Z2E3 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
APTXQ7Z2E3 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
APTXQ7Z2E3 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
APTXQ7Z2E3 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
APTXQ7Z2E3 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
APTXQ7Z2E3 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
APTXQ7Z2E3 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
APTXQ7Z2E3 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
APTXQ7Z2E3 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
APTXQ7Z2E3 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
APTXQ7Z2E3 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
APTXQ7Z2E3 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
APTXQ7Z2E3 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
APTXQ7Z2E3 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
APTXQ7Z2E3 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
APTXQ7Z2E3 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
APTXQ7Z2E3 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
APTXQ7Z2E3 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
APTXQ7Z2E3 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
APTXQ7Z2E3 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
APTXQ7Z2E3 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
APTXQ7Z2E3 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
APTXQ7Z2E3 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
APTXQ7Z2E3 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
APTXQ7Z2E3 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
APTXQ7Z2E3 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
APTXQ7Z2E3 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
APTXQ7Z2E3 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
APTXQ7Z2E3 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
APTXQ7Z2E3 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
APTXQ7Z2E3 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
APTXQ7Z2E3 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
APTXQ7Z2E3 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
APTXQ7Z2E3 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
APTXQ7Z2E3 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
APTXQ7Z2E3 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
APTXQ7Z2E3 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
APTXQ7Z2E3 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
APTXQ7Z2E3 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
APTXQ7Z2E3 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
APTXQ7Z2E3 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
APTXQ7Z2E3 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
APTXQ7Z2E3 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
APTXQ7Z2E3 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
APTXQ7Z2E3 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
APTXQ7Z2E3 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
APTXQ7Z2E3 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
APTXQ7Z2E3 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
APTXQ7Z2E3 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
APTXQ7Z2E3 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
APTXQ7Z2E3 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
APTXQ7Z2E3 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
APTXQ7Z2E3 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms