Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS5

OTOP3, Otopetrin-3, humanhuman

Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOP3Q7RTS5 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
OTOP3Q7RTS5 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
OTOP3Q7RTS5 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
OTOP3Q7RTS5 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
OTOP3Q7RTS5 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
OTOP3Q7RTS5 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
OTOP3Q7RTS5 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
OTOP3Q7RTS5 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
OTOP3Q7RTS5 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
OTOP3Q7RTS5 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
OTOP3Q7RTS5 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
OTOP3Q7RTS5 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
OTOP3Q7RTS5 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
OTOP3Q7RTS5 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
OTOP3Q7RTS5 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
OTOP3Q7RTS5 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
OTOP3Q7RTS5 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
OTOP3Q7RTS5 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
OTOP3Q7RTS5 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
OTOP3Q7RTS5 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
OTOP3Q7RTS5 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
OTOP3Q7RTS5 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
OTOP3Q7RTS5 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
OTOP3Q7RTS5 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
OTOP3Q7RTS5 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
OTOP3Q7RTS5 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
OTOP3Q7RTS5 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
OTOP3Q7RTS5 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
OTOP3Q7RTS5 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
OTOP3Q7RTS5 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
OTOP3Q7RTS5 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
OTOP3Q7RTS5 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
OTOP3Q7RTS5 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
OTOP3Q7RTS5 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
OTOP3Q7RTS5 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
OTOP3Q7RTS5 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
OTOP3Q7RTS5 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
OTOP3Q7RTS5 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
OTOP3Q7RTS5 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
OTOP3Q7RTS5 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
OTOP3Q7RTS5 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
OTOP3Q7RTS5 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
OTOP3Q7RTS5 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
OTOP3Q7RTS5 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
OTOP3Q7RTS5 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
OTOP3Q7RTS5 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
OTOP3Q7RTS5 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
OTOP3Q7RTS5 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
OTOP3Q7RTS5 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
OTOP3Q7RTS5 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
OTOP3Q7RTS5 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
OTOP3Q7RTS5 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
OTOP3Q7RTS5 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
OTOP3Q7RTS5 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
OTOP3Q7RTS5 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
OTOP3Q7RTS5 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
OTOP3Q7RTS5 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
OTOP3Q7RTS5 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
OTOP3Q7RTS5 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
OTOP3Q7RTS5 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
OTOP3Q7RTS5 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
OTOP3Q7RTS5 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
OTOP3Q7RTS5 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
OTOP3Q7RTS5 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
OTOP3Q7RTS5 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
OTOP3Q7RTS5 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
OTOP3Q7RTS5 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
OTOP3Q7RTS5 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
OTOP3Q7RTS5 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
OTOP3Q7RTS5 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
OTOP3Q7RTS5 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
OTOP3Q7RTS5 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
OTOP3Q7RTS5 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
OTOP3Q7RTS5 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
OTOP3Q7RTS5 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
OTOP3Q7RTS5 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
OTOP3Q7RTS5 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
OTOP3Q7RTS5 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
OTOP3Q7RTS5 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
OTOP3Q7RTS5 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
OTOP3Q7RTS5 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
OTOP3Q7RTS5 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
OTOP3Q7RTS5 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
OTOP3Q7RTS5 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
OTOP3Q7RTS5 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
OTOP3Q7RTS5 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
OTOP3Q7RTS5 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
OTOP3Q7RTS5 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
OTOP3Q7RTS5 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
OTOP3Q7RTS5 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
OTOP3Q7RTS5 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
OTOP3Q7RTS5 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
OTOP3Q7RTS5 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
OTOP3Q7RTS5 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
OTOP3Q7RTS5 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
OTOP3Q7RTS5 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
OTOP3Q7RTS5 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
OTOP3Q7RTS5 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
OTOP3Q7RTS5 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
OTOP3Q7RTS5 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms