Protein–RNA interactions for Protein: Q76M96

CCDC80, Coiled-coil domain-containing protein 80, humanhuman

Predictions only

Length 950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC80Q76M96 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC80Q76M96 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC80Q76M96 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC80Q76M96 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CCDC80Q76M96 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CCDC80Q76M96 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
CCDC80Q76M96 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
CCDC80Q76M96 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CCDC80Q76M96 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC80Q76M96 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC80Q76M96 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC80Q76M96 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC80Q76M96 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC80Q76M96 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC80Q76M96 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC80Q76M96 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC80Q76M96 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC80Q76M96 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC80Q76M96 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC80Q76M96 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC80Q76M96 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC80Q76M96 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC80Q76M96 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC80Q76M96 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC80Q76M96 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC80Q76M96 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC80Q76M96 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC80Q76M96 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC80Q76M96 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC80Q76M96 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC80Q76M96 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC80Q76M96 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC80Q76M96 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC80Q76M96 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC80Q76M96 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC80Q76M96 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC80Q76M96 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC80Q76M96 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC80Q76M96 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC80Q76M96 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC80Q76M96 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC80Q76M96 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC80Q76M96 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC80Q76M96 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC80Q76M96 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC80Q76M96 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC80Q76M96 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC80Q76M96 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC80Q76M96 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC80Q76M96 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC80Q76M96 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC80Q76M96 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC80Q76M96 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC80Q76M96 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC80Q76M96 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC80Q76M96 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC80Q76M96 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC80Q76M96 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC80Q76M96 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC80Q76M96 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC80Q76M96 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC80Q76M96 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC80Q76M96 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC80Q76M96 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC80Q76M96 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC80Q76M96 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC80Q76M96 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC80Q76M96 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC80Q76M96 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC80Q76M96 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC80Q76M96 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC80Q76M96 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC80Q76M96 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC80Q76M96 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC80Q76M96 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC80Q76M96 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC80Q76M96 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC80Q76M96 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC80Q76M96 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC80Q76M96 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC80Q76M96 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC80Q76M96 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC80Q76M96 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC80Q76M96 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC80Q76M96 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC80Q76M96 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC80Q76M96 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC80Q76M96 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC80Q76M96 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC80Q76M96 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC80Q76M96 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC80Q76M96 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC80Q76M96 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC80Q76M96 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC80Q76M96 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC80Q76M96 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC80Q76M96 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC80Q76M96 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC80Q76M96 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC80Q76M96 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms