Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV77

C9orf139, Uncharacterized protein C9orf139, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf139Q6ZV77 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
C9orf139Q6ZV77 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
C9orf139Q6ZV77 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
C9orf139Q6ZV77 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
C9orf139Q6ZV77 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
C9orf139Q6ZV77 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
C9orf139Q6ZV77 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
C9orf139Q6ZV77 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
C9orf139Q6ZV77 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
C9orf139Q6ZV77 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
C9orf139Q6ZV77 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
C9orf139Q6ZV77 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
C9orf139Q6ZV77 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
C9orf139Q6ZV77 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
C9orf139Q6ZV77 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
C9orf139Q6ZV77 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
C9orf139Q6ZV77 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
C9orf139Q6ZV77 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
C9orf139Q6ZV77 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
C9orf139Q6ZV77 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
C9orf139Q6ZV77 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
C9orf139Q6ZV77 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
C9orf139Q6ZV77 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
C9orf139Q6ZV77 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
C9orf139Q6ZV77 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
C9orf139Q6ZV77 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
C9orf139Q6ZV77 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
C9orf139Q6ZV77 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
C9orf139Q6ZV77 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
C9orf139Q6ZV77 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
C9orf139Q6ZV77 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
C9orf139Q6ZV77 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
C9orf139Q6ZV77 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
C9orf139Q6ZV77 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
C9orf139Q6ZV77 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
C9orf139Q6ZV77 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
C9orf139Q6ZV77 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
C9orf139Q6ZV77 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
C9orf139Q6ZV77 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
C9orf139Q6ZV77 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
C9orf139Q6ZV77 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
C9orf139Q6ZV77 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
C9orf139Q6ZV77 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
C9orf139Q6ZV77 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
C9orf139Q6ZV77 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
C9orf139Q6ZV77 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
C9orf139Q6ZV77 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
C9orf139Q6ZV77 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
C9orf139Q6ZV77 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
C9orf139Q6ZV77 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
C9orf139Q6ZV77 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
C9orf139Q6ZV77 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
C9orf139Q6ZV77 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
C9orf139Q6ZV77 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
C9orf139Q6ZV77 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
C9orf139Q6ZV77 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
C9orf139Q6ZV77 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
C9orf139Q6ZV77 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
C9orf139Q6ZV77 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
C9orf139Q6ZV77 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
C9orf139Q6ZV77 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
C9orf139Q6ZV77 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
C9orf139Q6ZV77 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
C9orf139Q6ZV77 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
C9orf139Q6ZV77 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
C9orf139Q6ZV77 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
C9orf139Q6ZV77 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
C9orf139Q6ZV77 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
C9orf139Q6ZV77 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
C9orf139Q6ZV77 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
C9orf139Q6ZV77 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
C9orf139Q6ZV77 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
C9orf139Q6ZV77 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
C9orf139Q6ZV77 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
C9orf139Q6ZV77 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
C9orf139Q6ZV77 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
C9orf139Q6ZV77 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
C9orf139Q6ZV77 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
C9orf139Q6ZV77 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
C9orf139Q6ZV77 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
C9orf139Q6ZV77 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
C9orf139Q6ZV77 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
C9orf139Q6ZV77 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
C9orf139Q6ZV77 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
C9orf139Q6ZV77 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
C9orf139Q6ZV77 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
C9orf139Q6ZV77 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
C9orf139Q6ZV77 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
C9orf139Q6ZV77 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
C9orf139Q6ZV77 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
C9orf139Q6ZV77 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
C9orf139Q6ZV77 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
C9orf139Q6ZV77 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
C9orf139Q6ZV77 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
C9orf139Q6ZV77 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
C9orf139Q6ZV77 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
C9orf139Q6ZV77 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
C9orf139Q6ZV77 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
C9orf139Q6ZV77 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
C9orf139Q6ZV77 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms