Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSY5

PPP1R3F, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 3F, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 799 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R3FQ6ZSY5 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
PPP1R3FQ6ZSY5 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PPP1R3FQ6ZSY5 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
PPP1R3FQ6ZSY5 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PPP1R3FQ6ZSY5 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PPP1R3FQ6ZSY5 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PPP1R3FQ6ZSY5 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PPP1R3FQ6ZSY5 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
PPP1R3FQ6ZSY5 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PPP1R3FQ6ZSY5 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PPP1R3FQ6ZSY5 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PPP1R3FQ6ZSY5 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PPP1R3FQ6ZSY5 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PPP1R3FQ6ZSY5 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PPP1R3FQ6ZSY5 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PPP1R3FQ6ZSY5 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PPP1R3FQ6ZSY5 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PPP1R3FQ6ZSY5 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
PPP1R3FQ6ZSY5 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PPP1R3FQ6ZSY5 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PPP1R3FQ6ZSY5 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PPP1R3FQ6ZSY5 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PPP1R3FQ6ZSY5 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PPP1R3FQ6ZSY5 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
PPP1R3FQ6ZSY5 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PPP1R3FQ6ZSY5 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PPP1R3FQ6ZSY5 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PPP1R3FQ6ZSY5 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PPP1R3FQ6ZSY5 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PPP1R3FQ6ZSY5 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PPP1R3FQ6ZSY5 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PPP1R3FQ6ZSY5 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PPP1R3FQ6ZSY5 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PPP1R3FQ6ZSY5 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PPP1R3FQ6ZSY5 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PPP1R3FQ6ZSY5 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PPP1R3FQ6ZSY5 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PPP1R3FQ6ZSY5 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
PPP1R3FQ6ZSY5 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PPP1R3FQ6ZSY5 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PPP1R3FQ6ZSY5 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PPP1R3FQ6ZSY5 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
PPP1R3FQ6ZSY5 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PPP1R3FQ6ZSY5 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PPP1R3FQ6ZSY5 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PPP1R3FQ6ZSY5 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PPP1R3FQ6ZSY5 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PPP1R3FQ6ZSY5 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PPP1R3FQ6ZSY5 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PPP1R3FQ6ZSY5 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PPP1R3FQ6ZSY5 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PPP1R3FQ6ZSY5 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PPP1R3FQ6ZSY5 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PPP1R3FQ6ZSY5 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PPP1R3FQ6ZSY5 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PPP1R3FQ6ZSY5 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
PPP1R3FQ6ZSY5 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PPP1R3FQ6ZSY5 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PPP1R3FQ6ZSY5 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PPP1R3FQ6ZSY5 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PPP1R3FQ6ZSY5 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PPP1R3FQ6ZSY5 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PPP1R3FQ6ZSY5 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PPP1R3FQ6ZSY5 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PPP1R3FQ6ZSY5 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PPP1R3FQ6ZSY5 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PPP1R3FQ6ZSY5 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PPP1R3FQ6ZSY5 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PPP1R3FQ6ZSY5 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PPP1R3FQ6ZSY5 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PPP1R3FQ6ZSY5 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PPP1R3FQ6ZSY5 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PPP1R3FQ6ZSY5 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PPP1R3FQ6ZSY5 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PPP1R3FQ6ZSY5 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PPP1R3FQ6ZSY5 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PPP1R3FQ6ZSY5 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PPP1R3FQ6ZSY5 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PPP1R3FQ6ZSY5 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PPP1R3FQ6ZSY5 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PPP1R3FQ6ZSY5 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
PPP1R3FQ6ZSY5 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PPP1R3FQ6ZSY5 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
PPP1R3FQ6ZSY5 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
PPP1R3FQ6ZSY5 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PPP1R3FQ6ZSY5 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
PPP1R3FQ6ZSY5 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PPP1R3FQ6ZSY5 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PPP1R3FQ6ZSY5 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PPP1R3FQ6ZSY5 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PPP1R3FQ6ZSY5 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PPP1R3FQ6ZSY5 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PPP1R3FQ6ZSY5 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
PPP1R3FQ6ZSY5 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PPP1R3FQ6ZSY5 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
PPP1R3FQ6ZSY5 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PPP1R3FQ6ZSY5 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PPP1R3FQ6ZSY5 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PPP1R3FQ6ZSY5 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PPP1R3FQ6ZSY5 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms