Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRR5

TMEM136, Transmembrane protein 136, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM136Q6ZRR5 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM136Q6ZRR5 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM136Q6ZRR5 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM136Q6ZRR5 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM136Q6ZRR5 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM136Q6ZRR5 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM136Q6ZRR5 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM136Q6ZRR5 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM136Q6ZRR5 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM136Q6ZRR5 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM136Q6ZRR5 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM136Q6ZRR5 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM136Q6ZRR5 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM136Q6ZRR5 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM136Q6ZRR5 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM136Q6ZRR5 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM136Q6ZRR5 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM136Q6ZRR5 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM136Q6ZRR5 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM136Q6ZRR5 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM136Q6ZRR5 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM136Q6ZRR5 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM136Q6ZRR5 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM136Q6ZRR5 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM136Q6ZRR5 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM136Q6ZRR5 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM136Q6ZRR5 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM136Q6ZRR5 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM136Q6ZRR5 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM136Q6ZRR5 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM136Q6ZRR5 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM136Q6ZRR5 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM136Q6ZRR5 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM136Q6ZRR5 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM136Q6ZRR5 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM136Q6ZRR5 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM136Q6ZRR5 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM136Q6ZRR5 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM136Q6ZRR5 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM136Q6ZRR5 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM136Q6ZRR5 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM136Q6ZRR5 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM136Q6ZRR5 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM136Q6ZRR5 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM136Q6ZRR5 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM136Q6ZRR5 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM136Q6ZRR5 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM136Q6ZRR5 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM136Q6ZRR5 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM136Q6ZRR5 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM136Q6ZRR5 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM136Q6ZRR5 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM136Q6ZRR5 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM136Q6ZRR5 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM136Q6ZRR5 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM136Q6ZRR5 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
TMEM136Q6ZRR5 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.18
TMEM136Q6ZRR5 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM136Q6ZRR5 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM136Q6ZRR5 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM136Q6ZRR5 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM136Q6ZRR5 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM136Q6ZRR5 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM136Q6ZRR5 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM136Q6ZRR5 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM136Q6ZRR5 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM136Q6ZRR5 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM136Q6ZRR5 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM136Q6ZRR5 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM136Q6ZRR5 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM136Q6ZRR5 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM136Q6ZRR5 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM136Q6ZRR5 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM136Q6ZRR5 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM136Q6ZRR5 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM136Q6ZRR5 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM136Q6ZRR5 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM136Q6ZRR5 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM136Q6ZRR5 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM136Q6ZRR5 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM136Q6ZRR5 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM136Q6ZRR5 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM136Q6ZRR5 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM136Q6ZRR5 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM136Q6ZRR5 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM136Q6ZRR5 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM136Q6ZRR5 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM136Q6ZRR5 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM136Q6ZRR5 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM136Q6ZRR5 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM136Q6ZRR5 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM136Q6ZRR5 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM136Q6ZRR5 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM136Q6ZRR5 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM136Q6ZRR5 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM136Q6ZRR5 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM136Q6ZRR5 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM136Q6ZRR5 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM136Q6ZRR5 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM136Q6ZRR5 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms