Protein–RNA interactions for Protein: Q6XYB7

LBX2, Transcription factor LBX2, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LBX2Q6XYB7 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
LBX2Q6XYB7 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LBX2Q6XYB7 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LBX2Q6XYB7 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LBX2Q6XYB7 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LBX2Q6XYB7 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
LBX2Q6XYB7 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LBX2Q6XYB7 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
LBX2Q6XYB7 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LBX2Q6XYB7 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
LBX2Q6XYB7 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LBX2Q6XYB7 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LBX2Q6XYB7 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LBX2Q6XYB7 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LBX2Q6XYB7 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LBX2Q6XYB7 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
LBX2Q6XYB7 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LBX2Q6XYB7 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LBX2Q6XYB7 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LBX2Q6XYB7 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LBX2Q6XYB7 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LBX2Q6XYB7 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
LBX2Q6XYB7 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LBX2Q6XYB7 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LBX2Q6XYB7 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LBX2Q6XYB7 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LBX2Q6XYB7 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LBX2Q6XYB7 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LBX2Q6XYB7 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LBX2Q6XYB7 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LBX2Q6XYB7 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LBX2Q6XYB7 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LBX2Q6XYB7 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LBX2Q6XYB7 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LBX2Q6XYB7 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
LBX2Q6XYB7 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LBX2Q6XYB7 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LBX2Q6XYB7 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
LBX2Q6XYB7 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LBX2Q6XYB7 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LBX2Q6XYB7 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LBX2Q6XYB7 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LBX2Q6XYB7 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LBX2Q6XYB7 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LBX2Q6XYB7 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
LBX2Q6XYB7 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LBX2Q6XYB7 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LBX2Q6XYB7 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
LBX2Q6XYB7 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LBX2Q6XYB7 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LBX2Q6XYB7 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LBX2Q6XYB7 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LBX2Q6XYB7 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LBX2Q6XYB7 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LBX2Q6XYB7 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LBX2Q6XYB7 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LBX2Q6XYB7 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LBX2Q6XYB7 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LBX2Q6XYB7 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LBX2Q6XYB7 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LBX2Q6XYB7 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LBX2Q6XYB7 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LBX2Q6XYB7 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LBX2Q6XYB7 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LBX2Q6XYB7 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LBX2Q6XYB7 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LBX2Q6XYB7 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LBX2Q6XYB7 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LBX2Q6XYB7 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LBX2Q6XYB7 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LBX2Q6XYB7 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LBX2Q6XYB7 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LBX2Q6XYB7 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LBX2Q6XYB7 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LBX2Q6XYB7 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
LBX2Q6XYB7 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LBX2Q6XYB7 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LBX2Q6XYB7 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LBX2Q6XYB7 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LBX2Q6XYB7 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LBX2Q6XYB7 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LBX2Q6XYB7 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LBX2Q6XYB7 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LBX2Q6XYB7 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LBX2Q6XYB7 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LBX2Q6XYB7 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LBX2Q6XYB7 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LBX2Q6XYB7 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LBX2Q6XYB7 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LBX2Q6XYB7 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LBX2Q6XYB7 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LBX2Q6XYB7 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
LBX2Q6XYB7 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LBX2Q6XYB7 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LBX2Q6XYB7 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LBX2Q6XYB7 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LBX2Q6XYB7 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LBX2Q6XYB7 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LBX2Q6XYB7 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LBX2Q6XYB7 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms