Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXZ0

TMIGD1, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD1Q6UXZ0 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TMIGD1Q6UXZ0 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TMIGD1Q6UXZ0 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TMIGD1Q6UXZ0 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TMIGD1Q6UXZ0 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TMIGD1Q6UXZ0 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TMIGD1Q6UXZ0 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TMIGD1Q6UXZ0 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TMIGD1Q6UXZ0 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TMIGD1Q6UXZ0 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TMIGD1Q6UXZ0 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TMIGD1Q6UXZ0 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TMIGD1Q6UXZ0 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TMIGD1Q6UXZ0 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TMIGD1Q6UXZ0 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TMIGD1Q6UXZ0 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TMIGD1Q6UXZ0 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TMIGD1Q6UXZ0 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TMIGD1Q6UXZ0 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TMIGD1Q6UXZ0 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TMIGD1Q6UXZ0 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TMIGD1Q6UXZ0 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TMIGD1Q6UXZ0 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TMIGD1Q6UXZ0 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TMIGD1Q6UXZ0 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TMIGD1Q6UXZ0 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TMIGD1Q6UXZ0 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TMIGD1Q6UXZ0 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TMIGD1Q6UXZ0 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TMIGD1Q6UXZ0 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
TMIGD1Q6UXZ0 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TMIGD1Q6UXZ0 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
TMIGD1Q6UXZ0 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TMIGD1Q6UXZ0 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
TMIGD1Q6UXZ0 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
TMIGD1Q6UXZ0 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
TMIGD1Q6UXZ0 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TMIGD1Q6UXZ0 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TMIGD1Q6UXZ0 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TMIGD1Q6UXZ0 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TMIGD1Q6UXZ0 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TMIGD1Q6UXZ0 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TMIGD1Q6UXZ0 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
TMIGD1Q6UXZ0 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TMIGD1Q6UXZ0 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TMIGD1Q6UXZ0 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TMIGD1Q6UXZ0 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TMIGD1Q6UXZ0 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TMIGD1Q6UXZ0 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TMIGD1Q6UXZ0 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TMIGD1Q6UXZ0 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TMIGD1Q6UXZ0 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
TMIGD1Q6UXZ0 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TMIGD1Q6UXZ0 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TMIGD1Q6UXZ0 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TMIGD1Q6UXZ0 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TMIGD1Q6UXZ0 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TMIGD1Q6UXZ0 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TMIGD1Q6UXZ0 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TMIGD1Q6UXZ0 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TMIGD1Q6UXZ0 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TMIGD1Q6UXZ0 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TMIGD1Q6UXZ0 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TMIGD1Q6UXZ0 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TMIGD1Q6UXZ0 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TMIGD1Q6UXZ0 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
TMIGD1Q6UXZ0 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TMIGD1Q6UXZ0 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TMIGD1Q6UXZ0 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TMIGD1Q6UXZ0 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TMIGD1Q6UXZ0 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TMIGD1Q6UXZ0 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TMIGD1Q6UXZ0 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TMIGD1Q6UXZ0 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TMIGD1Q6UXZ0 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TMIGD1Q6UXZ0 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TMIGD1Q6UXZ0 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TMIGD1Q6UXZ0 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TMIGD1Q6UXZ0 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TMIGD1Q6UXZ0 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TMIGD1Q6UXZ0 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TMIGD1Q6UXZ0 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TMIGD1Q6UXZ0 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TMIGD1Q6UXZ0 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TMIGD1Q6UXZ0 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TMIGD1Q6UXZ0 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TMIGD1Q6UXZ0 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TMIGD1Q6UXZ0 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TMIGD1Q6UXZ0 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TMIGD1Q6UXZ0 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TMIGD1Q6UXZ0 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TMIGD1Q6UXZ0 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TMIGD1Q6UXZ0 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TMIGD1Q6UXZ0 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TMIGD1Q6UXZ0 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TMIGD1Q6UXZ0 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TMIGD1Q6UXZ0 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TMIGD1Q6UXZ0 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TMIGD1Q6UXZ0 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TMIGD1Q6UXZ0 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms