Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWD8

C16orf54, Transmembrane protein C16orf54, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf54Q6UWD8 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
C16orf54Q6UWD8 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
C16orf54Q6UWD8 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
C16orf54Q6UWD8 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
C16orf54Q6UWD8 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
C16orf54Q6UWD8 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
C16orf54Q6UWD8 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
C16orf54Q6UWD8 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
C16orf54Q6UWD8 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
C16orf54Q6UWD8 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
C16orf54Q6UWD8 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
C16orf54Q6UWD8 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
C16orf54Q6UWD8 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
C16orf54Q6UWD8 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
C16orf54Q6UWD8 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
C16orf54Q6UWD8 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
C16orf54Q6UWD8 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
C16orf54Q6UWD8 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
C16orf54Q6UWD8 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
C16orf54Q6UWD8 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
C16orf54Q6UWD8 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
C16orf54Q6UWD8 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
C16orf54Q6UWD8 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
C16orf54Q6UWD8 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
C16orf54Q6UWD8 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
C16orf54Q6UWD8 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
C16orf54Q6UWD8 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
C16orf54Q6UWD8 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
C16orf54Q6UWD8 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C16orf54Q6UWD8 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
C16orf54Q6UWD8 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C16orf54Q6UWD8 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C16orf54Q6UWD8 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
C16orf54Q6UWD8 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
C16orf54Q6UWD8 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
C16orf54Q6UWD8 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C16orf54Q6UWD8 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C16orf54Q6UWD8 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C16orf54Q6UWD8 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C16orf54Q6UWD8 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C16orf54Q6UWD8 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C16orf54Q6UWD8 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C16orf54Q6UWD8 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C16orf54Q6UWD8 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C16orf54Q6UWD8 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C16orf54Q6UWD8 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C16orf54Q6UWD8 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C16orf54Q6UWD8 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C16orf54Q6UWD8 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C16orf54Q6UWD8 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C16orf54Q6UWD8 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C16orf54Q6UWD8 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C16orf54Q6UWD8 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C16orf54Q6UWD8 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C16orf54Q6UWD8 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C16orf54Q6UWD8 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C16orf54Q6UWD8 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C16orf54Q6UWD8 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C16orf54Q6UWD8 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C16orf54Q6UWD8 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C16orf54Q6UWD8 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C16orf54Q6UWD8 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C16orf54Q6UWD8 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C16orf54Q6UWD8 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C16orf54Q6UWD8 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C16orf54Q6UWD8 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
C16orf54Q6UWD8 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
C16orf54Q6UWD8 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
C16orf54Q6UWD8 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C16orf54Q6UWD8 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C16orf54Q6UWD8 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C16orf54Q6UWD8 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C16orf54Q6UWD8 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C16orf54Q6UWD8 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C16orf54Q6UWD8 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C16orf54Q6UWD8 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C16orf54Q6UWD8 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C16orf54Q6UWD8 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C16orf54Q6UWD8 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C16orf54Q6UWD8 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C16orf54Q6UWD8 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C16orf54Q6UWD8 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C16orf54Q6UWD8 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C16orf54Q6UWD8 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C16orf54Q6UWD8 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C16orf54Q6UWD8 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C16orf54Q6UWD8 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C16orf54Q6UWD8 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C16orf54Q6UWD8 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C16orf54Q6UWD8 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C16orf54Q6UWD8 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C16orf54Q6UWD8 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C16orf54Q6UWD8 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C16orf54Q6UWD8 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C16orf54Q6UWD8 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C16orf54Q6UWD8 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C16orf54Q6UWD8 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C16orf54Q6UWD8 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C16orf54Q6UWD8 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C16orf54Q6UWD8 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms