Protein–RNA interactions for Protein: Q6U841

SLC4A10, Sodium-driven chloride bicarbonate exchanger, humanhuman

Predictions only

Length 1,118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A10Q6U841 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
SLC4A10Q6U841 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SLC4A10Q6U841 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SLC4A10Q6U841 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SLC4A10Q6U841 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SLC4A10Q6U841 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SLC4A10Q6U841 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SLC4A10Q6U841 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SLC4A10Q6U841 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SLC4A10Q6U841 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SLC4A10Q6U841 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SLC4A10Q6U841 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SLC4A10Q6U841 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SLC4A10Q6U841 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SLC4A10Q6U841 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SLC4A10Q6U841 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SLC4A10Q6U841 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SLC4A10Q6U841 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SLC4A10Q6U841 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SLC4A10Q6U841 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SLC4A10Q6U841 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SLC4A10Q6U841 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
SLC4A10Q6U841 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SLC4A10Q6U841 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SLC4A10Q6U841 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SLC4A10Q6U841 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SLC4A10Q6U841 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SLC4A10Q6U841 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SLC4A10Q6U841 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SLC4A10Q6U841 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
SLC4A10Q6U841 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
SLC4A10Q6U841 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
SLC4A10Q6U841 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
SLC4A10Q6U841 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SLC4A10Q6U841 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SLC4A10Q6U841 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SLC4A10Q6U841 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SLC4A10Q6U841 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SLC4A10Q6U841 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SLC4A10Q6U841 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SLC4A10Q6U841 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SLC4A10Q6U841 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SLC4A10Q6U841 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SLC4A10Q6U841 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SLC4A10Q6U841 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SLC4A10Q6U841 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SLC4A10Q6U841 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SLC4A10Q6U841 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SLC4A10Q6U841 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SLC4A10Q6U841 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SLC4A10Q6U841 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SLC4A10Q6U841 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SLC4A10Q6U841 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SLC4A10Q6U841 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SLC4A10Q6U841 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SLC4A10Q6U841 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SLC4A10Q6U841 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SLC4A10Q6U841 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SLC4A10Q6U841 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SLC4A10Q6U841 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SLC4A10Q6U841 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SLC4A10Q6U841 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SLC4A10Q6U841 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SLC4A10Q6U841 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SLC4A10Q6U841 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SLC4A10Q6U841 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SLC4A10Q6U841 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
SLC4A10Q6U841 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SLC4A10Q6U841 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SLC4A10Q6U841 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SLC4A10Q6U841 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
SLC4A10Q6U841 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SLC4A10Q6U841 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SLC4A10Q6U841 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SLC4A10Q6U841 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SLC4A10Q6U841 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SLC4A10Q6U841 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SLC4A10Q6U841 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SLC4A10Q6U841 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SLC4A10Q6U841 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SLC4A10Q6U841 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SLC4A10Q6U841 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SLC4A10Q6U841 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SLC4A10Q6U841 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SLC4A10Q6U841 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
SLC4A10Q6U841 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SLC4A10Q6U841 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SLC4A10Q6U841 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SLC4A10Q6U841 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SLC4A10Q6U841 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SLC4A10Q6U841 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SLC4A10Q6U841 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SLC4A10Q6U841 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SLC4A10Q6U841 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SLC4A10Q6U841 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
SLC4A10Q6U841 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SLC4A10Q6U841 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SLC4A10Q6U841 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SLC4A10Q6U841 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
SLC4A10Q6U841 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms