Protein–RNA interactions for Protein: Q6QAJ8

TMEM220, Transmembrane protein 220, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM220Q6QAJ8 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM220Q6QAJ8 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM220Q6QAJ8 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM220Q6QAJ8 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM220Q6QAJ8 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM220Q6QAJ8 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TMEM220Q6QAJ8 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TMEM220Q6QAJ8 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM220Q6QAJ8 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM220Q6QAJ8 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM220Q6QAJ8 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM220Q6QAJ8 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM220Q6QAJ8 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM220Q6QAJ8 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM220Q6QAJ8 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM220Q6QAJ8 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM220Q6QAJ8 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM220Q6QAJ8 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM220Q6QAJ8 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM220Q6QAJ8 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM220Q6QAJ8 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM220Q6QAJ8 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TMEM220Q6QAJ8 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM220Q6QAJ8 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TMEM220Q6QAJ8 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM220Q6QAJ8 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TMEM220Q6QAJ8 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TMEM220Q6QAJ8 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TMEM220Q6QAJ8 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TMEM220Q6QAJ8 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
TMEM220Q6QAJ8 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TMEM220Q6QAJ8 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TMEM220Q6QAJ8 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
TMEM220Q6QAJ8 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TMEM220Q6QAJ8 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TMEM220Q6QAJ8 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TMEM220Q6QAJ8 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TMEM220Q6QAJ8 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TMEM220Q6QAJ8 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM220Q6QAJ8 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM220Q6QAJ8 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM220Q6QAJ8 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM220Q6QAJ8 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM220Q6QAJ8 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM220Q6QAJ8 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM220Q6QAJ8 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM220Q6QAJ8 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM220Q6QAJ8 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM220Q6QAJ8 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM220Q6QAJ8 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM220Q6QAJ8 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM220Q6QAJ8 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM220Q6QAJ8 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM220Q6QAJ8 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM220Q6QAJ8 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM220Q6QAJ8 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM220Q6QAJ8 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM220Q6QAJ8 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM220Q6QAJ8 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM220Q6QAJ8 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM220Q6QAJ8 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM220Q6QAJ8 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM220Q6QAJ8 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM220Q6QAJ8 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM220Q6QAJ8 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM220Q6QAJ8 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM220Q6QAJ8 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM220Q6QAJ8 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM220Q6QAJ8 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM220Q6QAJ8 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM220Q6QAJ8 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM220Q6QAJ8 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM220Q6QAJ8 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM220Q6QAJ8 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM220Q6QAJ8 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM220Q6QAJ8 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM220Q6QAJ8 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM220Q6QAJ8 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM220Q6QAJ8 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM220Q6QAJ8 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM220Q6QAJ8 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM220Q6QAJ8 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM220Q6QAJ8 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM220Q6QAJ8 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMEM220Q6QAJ8 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMEM220Q6QAJ8 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMEM220Q6QAJ8 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMEM220Q6QAJ8 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMEM220Q6QAJ8 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMEM220Q6QAJ8 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMEM220Q6QAJ8 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMEM220Q6QAJ8 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMEM220Q6QAJ8 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMEM220Q6QAJ8 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMEM220Q6QAJ8 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMEM220Q6QAJ8 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMEM220Q6QAJ8 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMEM220Q6QAJ8 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
TMEM220Q6QAJ8 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
TMEM220Q6QAJ8 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.3 ms