Protein–RNA interactions for Protein: Q6PKG0

LARP1, La-related protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,096 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LARP1Q6PKG0 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
LARP1Q6PKG0 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
LARP1Q6PKG0 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
LARP1Q6PKG0 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
LARP1Q6PKG0 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
LARP1Q6PKG0 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
LARP1Q6PKG0 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
LARP1Q6PKG0 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
LARP1Q6PKG0 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC28.91■■■□□ 2.22
LARP1Q6PKG0 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
LARP1Q6PKG0 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
LARP1Q6PKG0 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
LARP1Q6PKG0 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
LARP1Q6PKG0 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
LARP1Q6PKG0 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
LARP1Q6PKG0 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
LARP1Q6PKG0 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
LARP1Q6PKG0 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
LARP1Q6PKG0 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
LARP1Q6PKG0 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
LARP1Q6PKG0 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
LARP1Q6PKG0 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
LARP1Q6PKG0 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
LARP1Q6PKG0 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
LARP1Q6PKG0 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
LARP1Q6PKG0 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
LARP1Q6PKG0 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
LARP1Q6PKG0 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
LARP1Q6PKG0 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
LARP1Q6PKG0 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
LARP1Q6PKG0 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
LARP1Q6PKG0 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
LARP1Q6PKG0 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
LARP1Q6PKG0 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
LARP1Q6PKG0 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
LARP1Q6PKG0 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
LARP1Q6PKG0 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
LARP1Q6PKG0 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
LARP1Q6PKG0 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
LARP1Q6PKG0 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
LARP1Q6PKG0 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
LARP1Q6PKG0 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
LARP1Q6PKG0 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
LARP1Q6PKG0 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
LARP1Q6PKG0 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
LARP1Q6PKG0 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
LARP1Q6PKG0 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
LARP1Q6PKG0 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
LARP1Q6PKG0 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
LARP1Q6PKG0 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
LARP1Q6PKG0 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
LARP1Q6PKG0 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
LARP1Q6PKG0 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
LARP1Q6PKG0 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC28.84■■■□□ 2.21
LARP1Q6PKG0 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
LARP1Q6PKG0 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
LARP1Q6PKG0 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
LARP1Q6PKG0 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
LARP1Q6PKG0 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
LARP1Q6PKG0 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
LARP1Q6PKG0 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
LARP1Q6PKG0 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
LARP1Q6PKG0 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
LARP1Q6PKG0 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
LARP1Q6PKG0 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
LARP1Q6PKG0 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
LARP1Q6PKG0 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC28.83■■■□□ 2.21
LARP1Q6PKG0 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
LARP1Q6PKG0 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
LARP1Q6PKG0 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
LARP1Q6PKG0 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
LARP1Q6PKG0 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
LARP1Q6PKG0 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
LARP1Q6PKG0 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
LARP1Q6PKG0 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
LARP1Q6PKG0 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
LARP1Q6PKG0 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
LARP1Q6PKG0 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
LARP1Q6PKG0 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
LARP1Q6PKG0 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
LARP1Q6PKG0 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
LARP1Q6PKG0 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
LARP1Q6PKG0 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
LARP1Q6PKG0 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
LARP1Q6PKG0 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
LARP1Q6PKG0 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
LARP1Q6PKG0 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
LARP1Q6PKG0 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
LARP1Q6PKG0 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
LARP1Q6PKG0 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
LARP1Q6PKG0 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
LARP1Q6PKG0 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
LARP1Q6PKG0 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
LARP1Q6PKG0 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
LARP1Q6PKG0 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
LARP1Q6PKG0 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
LARP1Q6PKG0 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
LARP1Q6PKG0 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
LARP1Q6PKG0 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
LARP1Q6PKG0 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms