Protein–RNA interactions for Protein: Q6PII3

CCDC174, Coiled-coil domain-containing protein 174, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC174Q6PII3 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC174Q6PII3 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC174Q6PII3 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC174Q6PII3 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC174Q6PII3 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC174Q6PII3 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC174Q6PII3 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC174Q6PII3 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC174Q6PII3 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC174Q6PII3 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC174Q6PII3 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC174Q6PII3 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC174Q6PII3 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC174Q6PII3 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC174Q6PII3 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC174Q6PII3 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC174Q6PII3 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC174Q6PII3 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC174Q6PII3 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC174Q6PII3 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC174Q6PII3 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC174Q6PII3 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC174Q6PII3 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC174Q6PII3 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC174Q6PII3 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC174Q6PII3 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC174Q6PII3 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC174Q6PII3 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC174Q6PII3 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC174Q6PII3 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC174Q6PII3 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC174Q6PII3 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC174Q6PII3 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC174Q6PII3 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC174Q6PII3 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC174Q6PII3 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC174Q6PII3 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC174Q6PII3 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC174Q6PII3 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC174Q6PII3 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC174Q6PII3 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC174Q6PII3 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC174Q6PII3 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC174Q6PII3 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC174Q6PII3 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC174Q6PII3 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC174Q6PII3 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC174Q6PII3 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC174Q6PII3 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC174Q6PII3 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC174Q6PII3 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC174Q6PII3 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC174Q6PII3 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC174Q6PII3 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC174Q6PII3 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC174Q6PII3 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC174Q6PII3 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC174Q6PII3 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC174Q6PII3 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC174Q6PII3 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC174Q6PII3 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC174Q6PII3 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC174Q6PII3 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC174Q6PII3 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC174Q6PII3 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC174Q6PII3 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC174Q6PII3 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC174Q6PII3 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC174Q6PII3 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC174Q6PII3 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC174Q6PII3 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC174Q6PII3 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC174Q6PII3 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC174Q6PII3 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC174Q6PII3 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC174Q6PII3 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC174Q6PII3 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC174Q6PII3 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC174Q6PII3 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC174Q6PII3 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC174Q6PII3 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC174Q6PII3 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC174Q6PII3 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC174Q6PII3 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC174Q6PII3 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC174Q6PII3 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC174Q6PII3 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC174Q6PII3 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC174Q6PII3 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC174Q6PII3 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC174Q6PII3 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC174Q6PII3 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC174Q6PII3 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC174Q6PII3 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC174Q6PII3 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC174Q6PII3 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC174Q6PII3 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC174Q6PII3 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC174Q6PII3 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC174Q6PII3 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms