Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1K2

PMF1, Polyamine-modulated factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMF1Q6P1K2 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PMF1Q6P1K2 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PMF1Q6P1K2 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PMF1Q6P1K2 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PMF1Q6P1K2 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PMF1Q6P1K2 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PMF1Q6P1K2 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PMF1Q6P1K2 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PMF1Q6P1K2 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PMF1Q6P1K2 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PMF1Q6P1K2 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PMF1Q6P1K2 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PMF1Q6P1K2 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PMF1Q6P1K2 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PMF1Q6P1K2 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PMF1Q6P1K2 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PMF1Q6P1K2 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PMF1Q6P1K2 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PMF1Q6P1K2 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PMF1Q6P1K2 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PMF1Q6P1K2 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PMF1Q6P1K2 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PMF1Q6P1K2 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PMF1Q6P1K2 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PMF1Q6P1K2 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PMF1Q6P1K2 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PMF1Q6P1K2 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PMF1Q6P1K2 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PMF1Q6P1K2 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PMF1Q6P1K2 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PMF1Q6P1K2 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PMF1Q6P1K2 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PMF1Q6P1K2 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PMF1Q6P1K2 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PMF1Q6P1K2 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PMF1Q6P1K2 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PMF1Q6P1K2 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PMF1Q6P1K2 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PMF1Q6P1K2 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PMF1Q6P1K2 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PMF1Q6P1K2 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PMF1Q6P1K2 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PMF1Q6P1K2 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PMF1Q6P1K2 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PMF1Q6P1K2 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PMF1Q6P1K2 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PMF1Q6P1K2 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PMF1Q6P1K2 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PMF1Q6P1K2 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PMF1Q6P1K2 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PMF1Q6P1K2 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PMF1Q6P1K2 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PMF1Q6P1K2 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PMF1Q6P1K2 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PMF1Q6P1K2 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
PMF1Q6P1K2 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
PMF1Q6P1K2 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PMF1Q6P1K2 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PMF1Q6P1K2 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PMF1Q6P1K2 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PMF1Q6P1K2 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PMF1Q6P1K2 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PMF1Q6P1K2 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PMF1Q6P1K2 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PMF1Q6P1K2 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PMF1Q6P1K2 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PMF1Q6P1K2 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PMF1Q6P1K2 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PMF1Q6P1K2 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PMF1Q6P1K2 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PMF1Q6P1K2 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PMF1Q6P1K2 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PMF1Q6P1K2 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PMF1Q6P1K2 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PMF1Q6P1K2 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PMF1Q6P1K2 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PMF1Q6P1K2 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PMF1Q6P1K2 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PMF1Q6P1K2 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PMF1Q6P1K2 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PMF1Q6P1K2 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PMF1Q6P1K2 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PMF1Q6P1K2 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PMF1Q6P1K2 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PMF1Q6P1K2 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PMF1Q6P1K2 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PMF1Q6P1K2 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PMF1Q6P1K2 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PMF1Q6P1K2 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PMF1Q6P1K2 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PMF1Q6P1K2 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PMF1Q6P1K2 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PMF1Q6P1K2 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PMF1Q6P1K2 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PMF1Q6P1K2 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PMF1Q6P1K2 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PMF1Q6P1K2 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PMF1Q6P1K2 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PMF1Q6P1K2 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PMF1Q6P1K2 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms