Protein–RNA interactions for Protein: Q6A163

KRT39, Keratin, type I cytoskeletal 39, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT39Q6A163 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KRT39Q6A163 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KRT39Q6A163 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KRT39Q6A163 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KRT39Q6A163 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KRT39Q6A163 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KRT39Q6A163 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KRT39Q6A163 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KRT39Q6A163 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KRT39Q6A163 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KRT39Q6A163 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KRT39Q6A163 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KRT39Q6A163 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KRT39Q6A163 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KRT39Q6A163 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KRT39Q6A163 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KRT39Q6A163 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KRT39Q6A163 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KRT39Q6A163 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KRT39Q6A163 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KRT39Q6A163 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KRT39Q6A163 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
KRT39Q6A163 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KRT39Q6A163 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KRT39Q6A163 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KRT39Q6A163 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KRT39Q6A163 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT39Q6A163 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT39Q6A163 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT39Q6A163 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT39Q6A163 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT39Q6A163 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT39Q6A163 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT39Q6A163 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT39Q6A163 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT39Q6A163 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT39Q6A163 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT39Q6A163 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT39Q6A163 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT39Q6A163 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KRT39Q6A163 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KRT39Q6A163 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KRT39Q6A163 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KRT39Q6A163 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KRT39Q6A163 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KRT39Q6A163 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
KRT39Q6A163 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KRT39Q6A163 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KRT39Q6A163 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
KRT39Q6A163 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KRT39Q6A163 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KRT39Q6A163 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KRT39Q6A163 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KRT39Q6A163 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KRT39Q6A163 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KRT39Q6A163 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KRT39Q6A163 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KRT39Q6A163 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KRT39Q6A163 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KRT39Q6A163 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KRT39Q6A163 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KRT39Q6A163 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KRT39Q6A163 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KRT39Q6A163 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KRT39Q6A163 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KRT39Q6A163 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KRT39Q6A163 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KRT39Q6A163 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KRT39Q6A163 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KRT39Q6A163 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KRT39Q6A163 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KRT39Q6A163 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KRT39Q6A163 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KRT39Q6A163 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KRT39Q6A163 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KRT39Q6A163 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
KRT39Q6A163 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
KRT39Q6A163 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
KRT39Q6A163 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
KRT39Q6A163 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KRT39Q6A163 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KRT39Q6A163 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KRT39Q6A163 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KRT39Q6A163 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KRT39Q6A163 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KRT39Q6A163 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KRT39Q6A163 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KRT39Q6A163 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
KRT39Q6A163 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KRT39Q6A163 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KRT39Q6A163 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KRT39Q6A163 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KRT39Q6A163 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KRT39Q6A163 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KRT39Q6A163 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KRT39Q6A163 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KRT39Q6A163 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KRT39Q6A163 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KRT39Q6A163 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KRT39Q6A163 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms