Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXD3

SAMD13, Sterile alpha motif domain-containing protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD13Q5VXD3 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SAMD13Q5VXD3 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SAMD13Q5VXD3 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SAMD13Q5VXD3 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SAMD13Q5VXD3 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SAMD13Q5VXD3 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SAMD13Q5VXD3 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SAMD13Q5VXD3 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SAMD13Q5VXD3 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SAMD13Q5VXD3 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SAMD13Q5VXD3 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SAMD13Q5VXD3 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SAMD13Q5VXD3 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SAMD13Q5VXD3 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SAMD13Q5VXD3 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SAMD13Q5VXD3 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SAMD13Q5VXD3 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SAMD13Q5VXD3 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SAMD13Q5VXD3 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SAMD13Q5VXD3 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SAMD13Q5VXD3 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SAMD13Q5VXD3 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SAMD13Q5VXD3 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SAMD13Q5VXD3 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SAMD13Q5VXD3 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SAMD13Q5VXD3 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SAMD13Q5VXD3 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SAMD13Q5VXD3 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SAMD13Q5VXD3 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SAMD13Q5VXD3 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SAMD13Q5VXD3 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SAMD13Q5VXD3 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SAMD13Q5VXD3 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SAMD13Q5VXD3 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SAMD13Q5VXD3 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SAMD13Q5VXD3 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SAMD13Q5VXD3 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SAMD13Q5VXD3 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SAMD13Q5VXD3 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SAMD13Q5VXD3 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SAMD13Q5VXD3 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SAMD13Q5VXD3 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SAMD13Q5VXD3 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SAMD13Q5VXD3 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SAMD13Q5VXD3 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SAMD13Q5VXD3 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SAMD13Q5VXD3 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SAMD13Q5VXD3 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SAMD13Q5VXD3 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SAMD13Q5VXD3 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SAMD13Q5VXD3 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SAMD13Q5VXD3 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SAMD13Q5VXD3 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SAMD13Q5VXD3 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SAMD13Q5VXD3 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SAMD13Q5VXD3 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SAMD13Q5VXD3 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
SAMD13Q5VXD3 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SAMD13Q5VXD3 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SAMD13Q5VXD3 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SAMD13Q5VXD3 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SAMD13Q5VXD3 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SAMD13Q5VXD3 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SAMD13Q5VXD3 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SAMD13Q5VXD3 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SAMD13Q5VXD3 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SAMD13Q5VXD3 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SAMD13Q5VXD3 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SAMD13Q5VXD3 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SAMD13Q5VXD3 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SAMD13Q5VXD3 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SAMD13Q5VXD3 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SAMD13Q5VXD3 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SAMD13Q5VXD3 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SAMD13Q5VXD3 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SAMD13Q5VXD3 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SAMD13Q5VXD3 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SAMD13Q5VXD3 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SAMD13Q5VXD3 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SAMD13Q5VXD3 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SAMD13Q5VXD3 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SAMD13Q5VXD3 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SAMD13Q5VXD3 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SAMD13Q5VXD3 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SAMD13Q5VXD3 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SAMD13Q5VXD3 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SAMD13Q5VXD3 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SAMD13Q5VXD3 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SAMD13Q5VXD3 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SAMD13Q5VXD3 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SAMD13Q5VXD3 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SAMD13Q5VXD3 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SAMD13Q5VXD3 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SAMD13Q5VXD3 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SAMD13Q5VXD3 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SAMD13Q5VXD3 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SAMD13Q5VXD3 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SAMD13Q5VXD3 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SAMD13Q5VXD3 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SAMD13Q5VXD3 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms