Protein–RNA interactions for Protein: Q5VV17

OTUD1, OTU domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD1Q5VV17 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
OTUD1Q5VV17 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
OTUD1Q5VV17 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
OTUD1Q5VV17 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
OTUD1Q5VV17 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
OTUD1Q5VV17 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
OTUD1Q5VV17 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
OTUD1Q5VV17 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
OTUD1Q5VV17 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
OTUD1Q5VV17 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
OTUD1Q5VV17 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
OTUD1Q5VV17 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
OTUD1Q5VV17 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
OTUD1Q5VV17 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
OTUD1Q5VV17 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
OTUD1Q5VV17 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
OTUD1Q5VV17 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
OTUD1Q5VV17 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
OTUD1Q5VV17 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
OTUD1Q5VV17 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
OTUD1Q5VV17 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
OTUD1Q5VV17 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
OTUD1Q5VV17 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
OTUD1Q5VV17 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
OTUD1Q5VV17 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
OTUD1Q5VV17 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
OTUD1Q5VV17 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
OTUD1Q5VV17 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
OTUD1Q5VV17 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
OTUD1Q5VV17 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
OTUD1Q5VV17 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
OTUD1Q5VV17 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
OTUD1Q5VV17 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
OTUD1Q5VV17 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
OTUD1Q5VV17 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
OTUD1Q5VV17 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
OTUD1Q5VV17 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
OTUD1Q5VV17 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
OTUD1Q5VV17 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
OTUD1Q5VV17 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
OTUD1Q5VV17 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
OTUD1Q5VV17 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
OTUD1Q5VV17 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
OTUD1Q5VV17 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
OTUD1Q5VV17 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
OTUD1Q5VV17 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
OTUD1Q5VV17 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
OTUD1Q5VV17 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
OTUD1Q5VV17 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
OTUD1Q5VV17 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
OTUD1Q5VV17 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
OTUD1Q5VV17 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
OTUD1Q5VV17 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
OTUD1Q5VV17 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
OTUD1Q5VV17 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
OTUD1Q5VV17 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
OTUD1Q5VV17 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
OTUD1Q5VV17 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
OTUD1Q5VV17 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
OTUD1Q5VV17 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
OTUD1Q5VV17 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
OTUD1Q5VV17 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
OTUD1Q5VV17 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
OTUD1Q5VV17 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
OTUD1Q5VV17 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
OTUD1Q5VV17 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
OTUD1Q5VV17 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
OTUD1Q5VV17 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
OTUD1Q5VV17 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
OTUD1Q5VV17 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
OTUD1Q5VV17 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
OTUD1Q5VV17 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
OTUD1Q5VV17 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
OTUD1Q5VV17 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
OTUD1Q5VV17 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
OTUD1Q5VV17 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
OTUD1Q5VV17 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
OTUD1Q5VV17 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
OTUD1Q5VV17 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
OTUD1Q5VV17 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
OTUD1Q5VV17 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
OTUD1Q5VV17 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
OTUD1Q5VV17 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
OTUD1Q5VV17 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
OTUD1Q5VV17 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
OTUD1Q5VV17 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
OTUD1Q5VV17 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
OTUD1Q5VV17 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
OTUD1Q5VV17 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
OTUD1Q5VV17 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
OTUD1Q5VV17 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
OTUD1Q5VV17 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
OTUD1Q5VV17 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
OTUD1Q5VV17 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
OTUD1Q5VV17 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
OTUD1Q5VV17 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
OTUD1Q5VV17 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
OTUD1Q5VV17 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
OTUD1Q5VV17 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
OTUD1Q5VV17 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms