Protein–RNA interactions for Protein: Q5VST9

OBSCN, Obscurin, humanhuman

Predictions only

Length 7,968 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OBSCNQ5VST9 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
OBSCNQ5VST9 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
OBSCNQ5VST9 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
OBSCNQ5VST9 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.45
OBSCNQ5VST9 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
OBSCNQ5VST9 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.45
OBSCNQ5VST9 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC5.96□□□□□ -1.45
OBSCNQ5VST9 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.45
OBSCNQ5VST9 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
OBSCNQ5VST9 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
OBSCNQ5VST9 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
OBSCNQ5VST9 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
OBSCNQ5VST9 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC5.95□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
OBSCNQ5VST9 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms