Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSR9

SPANXN1, Sperm protein associated with the nucleus on the X chromosome N1, humanhuman

Predictions only

Length 72 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPANXN1Q5VSR9 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPANXN1Q5VSR9 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPANXN1Q5VSR9 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPANXN1Q5VSR9 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPANXN1Q5VSR9 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPANXN1Q5VSR9 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPANXN1Q5VSR9 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPANXN1Q5VSR9 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPANXN1Q5VSR9 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPANXN1Q5VSR9 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPANXN1Q5VSR9 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPANXN1Q5VSR9 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPANXN1Q5VSR9 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPANXN1Q5VSR9 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SPANXN1Q5VSR9 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPANXN1Q5VSR9 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPANXN1Q5VSR9 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPANXN1Q5VSR9 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SPANXN1Q5VSR9 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SPANXN1Q5VSR9 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SPANXN1Q5VSR9 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SPANXN1Q5VSR9 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SPANXN1Q5VSR9 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SPANXN1Q5VSR9 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPANXN1Q5VSR9 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPANXN1Q5VSR9 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPANXN1Q5VSR9 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPANXN1Q5VSR9 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPANXN1Q5VSR9 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPANXN1Q5VSR9 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPANXN1Q5VSR9 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPANXN1Q5VSR9 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPANXN1Q5VSR9 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPANXN1Q5VSR9 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SPANXN1Q5VSR9 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPANXN1Q5VSR9 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPANXN1Q5VSR9 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPANXN1Q5VSR9 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPANXN1Q5VSR9 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPANXN1Q5VSR9 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPANXN1Q5VSR9 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPANXN1Q5VSR9 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPANXN1Q5VSR9 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPANXN1Q5VSR9 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPANXN1Q5VSR9 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SPANXN1Q5VSR9 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPANXN1Q5VSR9 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPANXN1Q5VSR9 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPANXN1Q5VSR9 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPANXN1Q5VSR9 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPANXN1Q5VSR9 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPANXN1Q5VSR9 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPANXN1Q5VSR9 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPANXN1Q5VSR9 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPANXN1Q5VSR9 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPANXN1Q5VSR9 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPANXN1Q5VSR9 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPANXN1Q5VSR9 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPANXN1Q5VSR9 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SPANXN1Q5VSR9 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPANXN1Q5VSR9 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPANXN1Q5VSR9 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPANXN1Q5VSR9 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPANXN1Q5VSR9 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPANXN1Q5VSR9 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPANXN1Q5VSR9 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPANXN1Q5VSR9 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPANXN1Q5VSR9 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPANXN1Q5VSR9 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPANXN1Q5VSR9 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPANXN1Q5VSR9 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPANXN1Q5VSR9 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPANXN1Q5VSR9 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPANXN1Q5VSR9 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPANXN1Q5VSR9 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SPANXN1Q5VSR9 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SPANXN1Q5VSR9 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPANXN1Q5VSR9 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPANXN1Q5VSR9 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPANXN1Q5VSR9 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPANXN1Q5VSR9 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPANXN1Q5VSR9 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPANXN1Q5VSR9 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPANXN1Q5VSR9 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPANXN1Q5VSR9 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SPANXN1Q5VSR9 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPANXN1Q5VSR9 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPANXN1Q5VSR9 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPANXN1Q5VSR9 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPANXN1Q5VSR9 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPANXN1Q5VSR9 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPANXN1Q5VSR9 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPANXN1Q5VSR9 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SPANXN1Q5VSR9 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPANXN1Q5VSR9 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPANXN1Q5VSR9 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPANXN1Q5VSR9 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPANXN1Q5VSR9 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPANXN1Q5VSR9 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPANXN1Q5VSR9 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 980.3 ms