Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGI4

SAMD5, Sterile alpha motif domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD5Q5TGI4 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SAMD5Q5TGI4 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SAMD5Q5TGI4 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SAMD5Q5TGI4 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SAMD5Q5TGI4 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SAMD5Q5TGI4 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SAMD5Q5TGI4 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SAMD5Q5TGI4 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SAMD5Q5TGI4 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SAMD5Q5TGI4 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SAMD5Q5TGI4 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC16.71■□□□□ 0.26
SAMD5Q5TGI4 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SAMD5Q5TGI4 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SAMD5Q5TGI4 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SAMD5Q5TGI4 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SAMD5Q5TGI4 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SAMD5Q5TGI4 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SAMD5Q5TGI4 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SAMD5Q5TGI4 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SAMD5Q5TGI4 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SAMD5Q5TGI4 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SAMD5Q5TGI4 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SAMD5Q5TGI4 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SAMD5Q5TGI4 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SAMD5Q5TGI4 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SAMD5Q5TGI4 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SAMD5Q5TGI4 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SAMD5Q5TGI4 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SAMD5Q5TGI4 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SAMD5Q5TGI4 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SAMD5Q5TGI4 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SAMD5Q5TGI4 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SAMD5Q5TGI4 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SAMD5Q5TGI4 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SAMD5Q5TGI4 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SAMD5Q5TGI4 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SAMD5Q5TGI4 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SAMD5Q5TGI4 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SAMD5Q5TGI4 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SAMD5Q5TGI4 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SAMD5Q5TGI4 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SAMD5Q5TGI4 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SAMD5Q5TGI4 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SAMD5Q5TGI4 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SAMD5Q5TGI4 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SAMD5Q5TGI4 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SAMD5Q5TGI4 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SAMD5Q5TGI4 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SAMD5Q5TGI4 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SAMD5Q5TGI4 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SAMD5Q5TGI4 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SAMD5Q5TGI4 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SAMD5Q5TGI4 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SAMD5Q5TGI4 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SAMD5Q5TGI4 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SAMD5Q5TGI4 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SAMD5Q5TGI4 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SAMD5Q5TGI4 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SAMD5Q5TGI4 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SAMD5Q5TGI4 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SAMD5Q5TGI4 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SAMD5Q5TGI4 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SAMD5Q5TGI4 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SAMD5Q5TGI4 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SAMD5Q5TGI4 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SAMD5Q5TGI4 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SAMD5Q5TGI4 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SAMD5Q5TGI4 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SAMD5Q5TGI4 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SAMD5Q5TGI4 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SAMD5Q5TGI4 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SAMD5Q5TGI4 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SAMD5Q5TGI4 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SAMD5Q5TGI4 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SAMD5Q5TGI4 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SAMD5Q5TGI4 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SAMD5Q5TGI4 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SAMD5Q5TGI4 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SAMD5Q5TGI4 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SAMD5Q5TGI4 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SAMD5Q5TGI4 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SAMD5Q5TGI4 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SAMD5Q5TGI4 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SAMD5Q5TGI4 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SAMD5Q5TGI4 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SAMD5Q5TGI4 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SAMD5Q5TGI4 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SAMD5Q5TGI4 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SAMD5Q5TGI4 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SAMD5Q5TGI4 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SAMD5Q5TGI4 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SAMD5Q5TGI4 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SAMD5Q5TGI4 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SAMD5Q5TGI4 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SAMD5Q5TGI4 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SAMD5Q5TGI4 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SAMD5Q5TGI4 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SAMD5Q5TGI4 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SAMD5Q5TGI4 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SAMD5Q5TGI4 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms