Protein–RNA interactions for Protein: Q5T7N2

L1TD1, LINE-1 type transposase domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 865 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1TD1Q5T7N2 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
L1TD1Q5T7N2 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
L1TD1Q5T7N2 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
L1TD1Q5T7N2 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
L1TD1Q5T7N2 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
L1TD1Q5T7N2 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
L1TD1Q5T7N2 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
L1TD1Q5T7N2 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
L1TD1Q5T7N2 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
L1TD1Q5T7N2 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
L1TD1Q5T7N2 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
L1TD1Q5T7N2 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
L1TD1Q5T7N2 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
L1TD1Q5T7N2 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
L1TD1Q5T7N2 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
L1TD1Q5T7N2 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
L1TD1Q5T7N2 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
L1TD1Q5T7N2 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
L1TD1Q5T7N2 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
L1TD1Q5T7N2 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
L1TD1Q5T7N2 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
L1TD1Q5T7N2 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
L1TD1Q5T7N2 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
L1TD1Q5T7N2 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
L1TD1Q5T7N2 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
L1TD1Q5T7N2 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
L1TD1Q5T7N2 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
L1TD1Q5T7N2 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
L1TD1Q5T7N2 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
L1TD1Q5T7N2 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
L1TD1Q5T7N2 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
L1TD1Q5T7N2 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
L1TD1Q5T7N2 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
L1TD1Q5T7N2 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
L1TD1Q5T7N2 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
L1TD1Q5T7N2 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
L1TD1Q5T7N2 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
L1TD1Q5T7N2 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
L1TD1Q5T7N2 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
L1TD1Q5T7N2 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
L1TD1Q5T7N2 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
L1TD1Q5T7N2 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
L1TD1Q5T7N2 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
L1TD1Q5T7N2 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
L1TD1Q5T7N2 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
L1TD1Q5T7N2 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
L1TD1Q5T7N2 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
L1TD1Q5T7N2 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
L1TD1Q5T7N2 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
L1TD1Q5T7N2 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
L1TD1Q5T7N2 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
L1TD1Q5T7N2 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
L1TD1Q5T7N2 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
L1TD1Q5T7N2 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
L1TD1Q5T7N2 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
L1TD1Q5T7N2 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
L1TD1Q5T7N2 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
L1TD1Q5T7N2 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
L1TD1Q5T7N2 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
L1TD1Q5T7N2 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
L1TD1Q5T7N2 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
L1TD1Q5T7N2 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
L1TD1Q5T7N2 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
L1TD1Q5T7N2 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
L1TD1Q5T7N2 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
L1TD1Q5T7N2 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
L1TD1Q5T7N2 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
L1TD1Q5T7N2 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
L1TD1Q5T7N2 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
L1TD1Q5T7N2 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
L1TD1Q5T7N2 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
L1TD1Q5T7N2 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
L1TD1Q5T7N2 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
L1TD1Q5T7N2 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
L1TD1Q5T7N2 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
L1TD1Q5T7N2 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
L1TD1Q5T7N2 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
L1TD1Q5T7N2 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
L1TD1Q5T7N2 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
L1TD1Q5T7N2 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
L1TD1Q5T7N2 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
L1TD1Q5T7N2 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
L1TD1Q5T7N2 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
L1TD1Q5T7N2 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
L1TD1Q5T7N2 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
L1TD1Q5T7N2 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
L1TD1Q5T7N2 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
L1TD1Q5T7N2 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
L1TD1Q5T7N2 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
L1TD1Q5T7N2 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
L1TD1Q5T7N2 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
L1TD1Q5T7N2 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
L1TD1Q5T7N2 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
L1TD1Q5T7N2 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
L1TD1Q5T7N2 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
L1TD1Q5T7N2 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
L1TD1Q5T7N2 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
L1TD1Q5T7N2 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
L1TD1Q5T7N2 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
L1TD1Q5T7N2 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms