Protein–RNA interactions for Protein: Q5T215

TRAPPC3L, Trafficking protein particle complex subunit 3-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3LQ5T215 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TRAPPC3LQ5T215 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TRAPPC3LQ5T215 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TRAPPC3LQ5T215 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
TRAPPC3LQ5T215 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TRAPPC3LQ5T215 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TRAPPC3LQ5T215 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
TRAPPC3LQ5T215 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TRAPPC3LQ5T215 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TRAPPC3LQ5T215 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
TRAPPC3LQ5T215 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TRAPPC3LQ5T215 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TRAPPC3LQ5T215 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TRAPPC3LQ5T215 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TRAPPC3LQ5T215 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
TRAPPC3LQ5T215 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TRAPPC3LQ5T215 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TRAPPC3LQ5T215 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TRAPPC3LQ5T215 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TRAPPC3LQ5T215 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TRAPPC3LQ5T215 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TRAPPC3LQ5T215 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TRAPPC3LQ5T215 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TRAPPC3LQ5T215 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TRAPPC3LQ5T215 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TRAPPC3LQ5T215 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TRAPPC3LQ5T215 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TRAPPC3LQ5T215 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
TRAPPC3LQ5T215 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
TRAPPC3LQ5T215 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.99
TRAPPC3LQ5T215 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
TRAPPC3LQ5T215 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
TRAPPC3LQ5T215 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TRAPPC3LQ5T215 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TRAPPC3LQ5T215 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TRAPPC3LQ5T215 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TRAPPC3LQ5T215 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TRAPPC3LQ5T215 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TRAPPC3LQ5T215 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TRAPPC3LQ5T215 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TRAPPC3LQ5T215 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TRAPPC3LQ5T215 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TRAPPC3LQ5T215 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TRAPPC3LQ5T215 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
TRAPPC3LQ5T215 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TRAPPC3LQ5T215 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
TRAPPC3LQ5T215 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
TRAPPC3LQ5T215 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TRAPPC3LQ5T215 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TRAPPC3LQ5T215 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TRAPPC3LQ5T215 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TRAPPC3LQ5T215 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TRAPPC3LQ5T215 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TRAPPC3LQ5T215 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TRAPPC3LQ5T215 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TRAPPC3LQ5T215 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TRAPPC3LQ5T215 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TRAPPC3LQ5T215 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TRAPPC3LQ5T215 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TRAPPC3LQ5T215 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TRAPPC3LQ5T215 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TRAPPC3LQ5T215 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TRAPPC3LQ5T215 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TRAPPC3LQ5T215 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TRAPPC3LQ5T215 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
TRAPPC3LQ5T215 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TRAPPC3LQ5T215 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
TRAPPC3LQ5T215 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TRAPPC3LQ5T215 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
TRAPPC3LQ5T215 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
TRAPPC3LQ5T215 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TRAPPC3LQ5T215 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TRAPPC3LQ5T215 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TRAPPC3LQ5T215 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TRAPPC3LQ5T215 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TRAPPC3LQ5T215 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRAPPC3LQ5T215 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRAPPC3LQ5T215 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRAPPC3LQ5T215 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRAPPC3LQ5T215 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRAPPC3LQ5T215 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRAPPC3LQ5T215 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRAPPC3LQ5T215 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRAPPC3LQ5T215 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRAPPC3LQ5T215 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
TRAPPC3LQ5T215 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
TRAPPC3LQ5T215 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TRAPPC3LQ5T215 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TRAPPC3LQ5T215 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TRAPPC3LQ5T215 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
TRAPPC3LQ5T215 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TRAPPC3LQ5T215 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TRAPPC3LQ5T215 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TRAPPC3LQ5T215 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TRAPPC3LQ5T215 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TRAPPC3LQ5T215 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TRAPPC3LQ5T215 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TRAPPC3LQ5T215 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TRAPPC3LQ5T215 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.97
TRAPPC3LQ5T215 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms