Protein–RNA interactions for Protein: Q5PSV4

BRMS1L, Breast cancer metastasis-suppressor 1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRMS1LQ5PSV4 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BRMS1LQ5PSV4 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BRMS1LQ5PSV4 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BRMS1LQ5PSV4 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BRMS1LQ5PSV4 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BRMS1LQ5PSV4 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BRMS1LQ5PSV4 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BRMS1LQ5PSV4 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BRMS1LQ5PSV4 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BRMS1LQ5PSV4 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BRMS1LQ5PSV4 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BRMS1LQ5PSV4 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BRMS1LQ5PSV4 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BRMS1LQ5PSV4 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BRMS1LQ5PSV4 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BRMS1LQ5PSV4 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BRMS1LQ5PSV4 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BRMS1LQ5PSV4 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BRMS1LQ5PSV4 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BRMS1LQ5PSV4 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BRMS1LQ5PSV4 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BRMS1LQ5PSV4 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BRMS1LQ5PSV4 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BRMS1LQ5PSV4 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
BRMS1LQ5PSV4 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BRMS1LQ5PSV4 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BRMS1LQ5PSV4 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BRMS1LQ5PSV4 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BRMS1LQ5PSV4 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BRMS1LQ5PSV4 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BRMS1LQ5PSV4 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
BRMS1LQ5PSV4 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BRMS1LQ5PSV4 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BRMS1LQ5PSV4 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BRMS1LQ5PSV4 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BRMS1LQ5PSV4 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BRMS1LQ5PSV4 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BRMS1LQ5PSV4 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BRMS1LQ5PSV4 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BRMS1LQ5PSV4 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BRMS1LQ5PSV4 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BRMS1LQ5PSV4 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BRMS1LQ5PSV4 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BRMS1LQ5PSV4 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BRMS1LQ5PSV4 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BRMS1LQ5PSV4 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
BRMS1LQ5PSV4 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BRMS1LQ5PSV4 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BRMS1LQ5PSV4 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BRMS1LQ5PSV4 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BRMS1LQ5PSV4 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
BRMS1LQ5PSV4 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BRMS1LQ5PSV4 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BRMS1LQ5PSV4 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BRMS1LQ5PSV4 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BRMS1LQ5PSV4 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
BRMS1LQ5PSV4 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BRMS1LQ5PSV4 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
BRMS1LQ5PSV4 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BRMS1LQ5PSV4 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BRMS1LQ5PSV4 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BRMS1LQ5PSV4 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BRMS1LQ5PSV4 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BRMS1LQ5PSV4 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BRMS1LQ5PSV4 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
BRMS1LQ5PSV4 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
BRMS1LQ5PSV4 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
BRMS1LQ5PSV4 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
BRMS1LQ5PSV4 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BRMS1LQ5PSV4 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BRMS1LQ5PSV4 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BRMS1LQ5PSV4 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BRMS1LQ5PSV4 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BRMS1LQ5PSV4 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BRMS1LQ5PSV4 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BRMS1LQ5PSV4 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BRMS1LQ5PSV4 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BRMS1LQ5PSV4 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BRMS1LQ5PSV4 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BRMS1LQ5PSV4 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BRMS1LQ5PSV4 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BRMS1LQ5PSV4 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BRMS1LQ5PSV4 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BRMS1LQ5PSV4 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BRMS1LQ5PSV4 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BRMS1LQ5PSV4 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BRMS1LQ5PSV4 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BRMS1LQ5PSV4 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BRMS1LQ5PSV4 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BRMS1LQ5PSV4 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BRMS1LQ5PSV4 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BRMS1LQ5PSV4 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BRMS1LQ5PSV4 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
BRMS1LQ5PSV4 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
BRMS1LQ5PSV4 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
BRMS1LQ5PSV4 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BRMS1LQ5PSV4 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BRMS1LQ5PSV4 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BRMS1LQ5PSV4 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BRMS1LQ5PSV4 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms