Protein–RNA interactions for Protein: Q5KU26

COLEC12, Collectin-12, humanhuman

Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COLEC12Q5KU26 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
COLEC12Q5KU26 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
COLEC12Q5KU26 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
COLEC12Q5KU26 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
COLEC12Q5KU26 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
COLEC12Q5KU26 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
COLEC12Q5KU26 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
COLEC12Q5KU26 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
COLEC12Q5KU26 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
COLEC12Q5KU26 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
COLEC12Q5KU26 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
COLEC12Q5KU26 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
COLEC12Q5KU26 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
COLEC12Q5KU26 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
COLEC12Q5KU26 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
COLEC12Q5KU26 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
COLEC12Q5KU26 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
COLEC12Q5KU26 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
COLEC12Q5KU26 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
COLEC12Q5KU26 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
COLEC12Q5KU26 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
COLEC12Q5KU26 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
COLEC12Q5KU26 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
COLEC12Q5KU26 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
COLEC12Q5KU26 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
COLEC12Q5KU26 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
COLEC12Q5KU26 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
COLEC12Q5KU26 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
COLEC12Q5KU26 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
COLEC12Q5KU26 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
COLEC12Q5KU26 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
COLEC12Q5KU26 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
COLEC12Q5KU26 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
COLEC12Q5KU26 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
COLEC12Q5KU26 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
COLEC12Q5KU26 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
COLEC12Q5KU26 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
COLEC12Q5KU26 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
COLEC12Q5KU26 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
COLEC12Q5KU26 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
COLEC12Q5KU26 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
COLEC12Q5KU26 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
COLEC12Q5KU26 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
COLEC12Q5KU26 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
COLEC12Q5KU26 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
COLEC12Q5KU26 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
COLEC12Q5KU26 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
COLEC12Q5KU26 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
COLEC12Q5KU26 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
COLEC12Q5KU26 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
COLEC12Q5KU26 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
COLEC12Q5KU26 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
COLEC12Q5KU26 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
COLEC12Q5KU26 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
COLEC12Q5KU26 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
COLEC12Q5KU26 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
COLEC12Q5KU26 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
COLEC12Q5KU26 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
COLEC12Q5KU26 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
COLEC12Q5KU26 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
COLEC12Q5KU26 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
COLEC12Q5KU26 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
COLEC12Q5KU26 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
COLEC12Q5KU26 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
COLEC12Q5KU26 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
COLEC12Q5KU26 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
COLEC12Q5KU26 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
COLEC12Q5KU26 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC20.65■□□□□ 0.9
COLEC12Q5KU26 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
COLEC12Q5KU26 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
COLEC12Q5KU26 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
COLEC12Q5KU26 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
COLEC12Q5KU26 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
COLEC12Q5KU26 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
COLEC12Q5KU26 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
COLEC12Q5KU26 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
COLEC12Q5KU26 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
COLEC12Q5KU26 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
COLEC12Q5KU26 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
COLEC12Q5KU26 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
COLEC12Q5KU26 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
COLEC12Q5KU26 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
COLEC12Q5KU26 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
COLEC12Q5KU26 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
COLEC12Q5KU26 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
COLEC12Q5KU26 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
COLEC12Q5KU26 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
COLEC12Q5KU26 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
COLEC12Q5KU26 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
COLEC12Q5KU26 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
COLEC12Q5KU26 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
COLEC12Q5KU26 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
COLEC12Q5KU26 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
COLEC12Q5KU26 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
COLEC12Q5KU26 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
COLEC12Q5KU26 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
COLEC12Q5KU26 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
COLEC12Q5KU26 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
COLEC12Q5KU26 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
COLEC12Q5KU26 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms