Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVF3

PCID2, PCI domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCID2Q5JVF3 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PCID2Q5JVF3 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PCID2Q5JVF3 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PCID2Q5JVF3 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PCID2Q5JVF3 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PCID2Q5JVF3 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PCID2Q5JVF3 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PCID2Q5JVF3 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PCID2Q5JVF3 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PCID2Q5JVF3 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PCID2Q5JVF3 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PCID2Q5JVF3 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PCID2Q5JVF3 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PCID2Q5JVF3 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PCID2Q5JVF3 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PCID2Q5JVF3 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PCID2Q5JVF3 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PCID2Q5JVF3 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PCID2Q5JVF3 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PCID2Q5JVF3 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PCID2Q5JVF3 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PCID2Q5JVF3 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PCID2Q5JVF3 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PCID2Q5JVF3 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PCID2Q5JVF3 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PCID2Q5JVF3 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PCID2Q5JVF3 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PCID2Q5JVF3 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PCID2Q5JVF3 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PCID2Q5JVF3 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PCID2Q5JVF3 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PCID2Q5JVF3 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PCID2Q5JVF3 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PCID2Q5JVF3 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PCID2Q5JVF3 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PCID2Q5JVF3 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PCID2Q5JVF3 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PCID2Q5JVF3 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PCID2Q5JVF3 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PCID2Q5JVF3 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PCID2Q5JVF3 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PCID2Q5JVF3 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PCID2Q5JVF3 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PCID2Q5JVF3 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PCID2Q5JVF3 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PCID2Q5JVF3 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PCID2Q5JVF3 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PCID2Q5JVF3 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PCID2Q5JVF3 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PCID2Q5JVF3 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PCID2Q5JVF3 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PCID2Q5JVF3 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PCID2Q5JVF3 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PCID2Q5JVF3 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PCID2Q5JVF3 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PCID2Q5JVF3 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PCID2Q5JVF3 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PCID2Q5JVF3 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PCID2Q5JVF3 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PCID2Q5JVF3 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PCID2Q5JVF3 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PCID2Q5JVF3 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PCID2Q5JVF3 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PCID2Q5JVF3 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PCID2Q5JVF3 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PCID2Q5JVF3 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PCID2Q5JVF3 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PCID2Q5JVF3 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PCID2Q5JVF3 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PCID2Q5JVF3 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PCID2Q5JVF3 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PCID2Q5JVF3 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PCID2Q5JVF3 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PCID2Q5JVF3 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PCID2Q5JVF3 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
PCID2Q5JVF3 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
PCID2Q5JVF3 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PCID2Q5JVF3 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PCID2Q5JVF3 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PCID2Q5JVF3 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PCID2Q5JVF3 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PCID2Q5JVF3 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PCID2Q5JVF3 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PCID2Q5JVF3 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PCID2Q5JVF3 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PCID2Q5JVF3 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PCID2Q5JVF3 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PCID2Q5JVF3 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PCID2Q5JVF3 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PCID2Q5JVF3 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PCID2Q5JVF3 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PCID2Q5JVF3 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PCID2Q5JVF3 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PCID2Q5JVF3 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PCID2Q5JVF3 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PCID2Q5JVF3 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PCID2Q5JVF3 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PCID2Q5JVF3 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PCID2Q5JVF3 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PCID2Q5JVF3 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms