Protein–RNA interactions for Protein: Q5HYW3

RTL5, Retrotransposon Gag-like protein 5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 569 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL5Q5HYW3 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RTL5Q5HYW3 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RTL5Q5HYW3 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RTL5Q5HYW3 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RTL5Q5HYW3 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RTL5Q5HYW3 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RTL5Q5HYW3 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RTL5Q5HYW3 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RTL5Q5HYW3 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
RTL5Q5HYW3 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
RTL5Q5HYW3 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
RTL5Q5HYW3 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RTL5Q5HYW3 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RTL5Q5HYW3 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RTL5Q5HYW3 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RTL5Q5HYW3 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RTL5Q5HYW3 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RTL5Q5HYW3 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RTL5Q5HYW3 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RTL5Q5HYW3 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RTL5Q5HYW3 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RTL5Q5HYW3 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RTL5Q5HYW3 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RTL5Q5HYW3 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RTL5Q5HYW3 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RTL5Q5HYW3 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RTL5Q5HYW3 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RTL5Q5HYW3 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RTL5Q5HYW3 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RTL5Q5HYW3 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RTL5Q5HYW3 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RTL5Q5HYW3 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RTL5Q5HYW3 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RTL5Q5HYW3 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RTL5Q5HYW3 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RTL5Q5HYW3 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RTL5Q5HYW3 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RTL5Q5HYW3 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RTL5Q5HYW3 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RTL5Q5HYW3 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
RTL5Q5HYW3 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
RTL5Q5HYW3 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
RTL5Q5HYW3 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RTL5Q5HYW3 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RTL5Q5HYW3 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RTL5Q5HYW3 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.08
RTL5Q5HYW3 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RTL5Q5HYW3 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RTL5Q5HYW3 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RTL5Q5HYW3 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RTL5Q5HYW3 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RTL5Q5HYW3 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RTL5Q5HYW3 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RTL5Q5HYW3 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RTL5Q5HYW3 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RTL5Q5HYW3 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RTL5Q5HYW3 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
RTL5Q5HYW3 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RTL5Q5HYW3 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC28■■■□□ 2.07
RTL5Q5HYW3 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RTL5Q5HYW3 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
RTL5Q5HYW3 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
RTL5Q5HYW3 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RTL5Q5HYW3 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RTL5Q5HYW3 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RTL5Q5HYW3 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RTL5Q5HYW3 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RTL5Q5HYW3 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
RTL5Q5HYW3 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
RTL5Q5HYW3 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
RTL5Q5HYW3 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RTL5Q5HYW3 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RTL5Q5HYW3 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RTL5Q5HYW3 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
RTL5Q5HYW3 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RTL5Q5HYW3 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RTL5Q5HYW3 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RTL5Q5HYW3 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
RTL5Q5HYW3 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RTL5Q5HYW3 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RTL5Q5HYW3 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RTL5Q5HYW3 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RTL5Q5HYW3 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RTL5Q5HYW3 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RTL5Q5HYW3 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
RTL5Q5HYW3 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RTL5Q5HYW3 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RTL5Q5HYW3 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RTL5Q5HYW3 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RTL5Q5HYW3 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RTL5Q5HYW3 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RTL5Q5HYW3 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
RTL5Q5HYW3 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RTL5Q5HYW3 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RTL5Q5HYW3 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RTL5Q5HYW3 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RTL5Q5HYW3 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RTL5Q5HYW3 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RTL5Q5HYW3 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RTL5Q5HYW3 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms