Protein–RNA interactions for Protein: Q504U0

C4orf46, Renal cancer differentiation gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf46Q504U0 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C4orf46Q504U0 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
C4orf46Q504U0 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
C4orf46Q504U0 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
C4orf46Q504U0 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
C4orf46Q504U0 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C4orf46Q504U0 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C4orf46Q504U0 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
C4orf46Q504U0 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C4orf46Q504U0 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
C4orf46Q504U0 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
C4orf46Q504U0 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
C4orf46Q504U0 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C4orf46Q504U0 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
C4orf46Q504U0 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C4orf46Q504U0 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
C4orf46Q504U0 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C4orf46Q504U0 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
C4orf46Q504U0 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
C4orf46Q504U0 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
C4orf46Q504U0 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
C4orf46Q504U0 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
C4orf46Q504U0 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
C4orf46Q504U0 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
C4orf46Q504U0 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
C4orf46Q504U0 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
C4orf46Q504U0 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
C4orf46Q504U0 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
C4orf46Q504U0 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
C4orf46Q504U0 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
C4orf46Q504U0 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
C4orf46Q504U0 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
C4orf46Q504U0 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
C4orf46Q504U0 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
C4orf46Q504U0 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
C4orf46Q504U0 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
C4orf46Q504U0 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
C4orf46Q504U0 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
C4orf46Q504U0 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C4orf46Q504U0 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C4orf46Q504U0 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C4orf46Q504U0 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
C4orf46Q504U0 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
C4orf46Q504U0 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
C4orf46Q504U0 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
C4orf46Q504U0 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C4orf46Q504U0 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C4orf46Q504U0 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C4orf46Q504U0 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C4orf46Q504U0 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C4orf46Q504U0 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C4orf46Q504U0 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C4orf46Q504U0 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C4orf46Q504U0 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C4orf46Q504U0 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
C4orf46Q504U0 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C4orf46Q504U0 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C4orf46Q504U0 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C4orf46Q504U0 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C4orf46Q504U0 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C4orf46Q504U0 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C4orf46Q504U0 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C4orf46Q504U0 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C4orf46Q504U0 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C4orf46Q504U0 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C4orf46Q504U0 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C4orf46Q504U0 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C4orf46Q504U0 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C4orf46Q504U0 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
C4orf46Q504U0 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C4orf46Q504U0 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C4orf46Q504U0 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C4orf46Q504U0 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C4orf46Q504U0 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C4orf46Q504U0 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C4orf46Q504U0 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
C4orf46Q504U0 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C4orf46Q504U0 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C4orf46Q504U0 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C4orf46Q504U0 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C4orf46Q504U0 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C4orf46Q504U0 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C4orf46Q504U0 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C4orf46Q504U0 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C4orf46Q504U0 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C4orf46Q504U0 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C4orf46Q504U0 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C4orf46Q504U0 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C4orf46Q504U0 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C4orf46Q504U0 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C4orf46Q504U0 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C4orf46Q504U0 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C4orf46Q504U0 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C4orf46Q504U0 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C4orf46Q504U0 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C4orf46Q504U0 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C4orf46Q504U0 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C4orf46Q504U0 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C4orf46Q504U0 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C4orf46Q504U0 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms