Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0W2

DUSP28, Dual specificity phosphatase 28, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP28Q4G0W2 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DUSP28Q4G0W2 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DUSP28Q4G0W2 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
DUSP28Q4G0W2 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DUSP28Q4G0W2 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DUSP28Q4G0W2 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DUSP28Q4G0W2 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DUSP28Q4G0W2 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DUSP28Q4G0W2 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DUSP28Q4G0W2 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DUSP28Q4G0W2 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DUSP28Q4G0W2 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DUSP28Q4G0W2 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DUSP28Q4G0W2 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DUSP28Q4G0W2 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DUSP28Q4G0W2 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DUSP28Q4G0W2 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DUSP28Q4G0W2 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DUSP28Q4G0W2 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DUSP28Q4G0W2 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DUSP28Q4G0W2 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DUSP28Q4G0W2 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DUSP28Q4G0W2 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DUSP28Q4G0W2 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
DUSP28Q4G0W2 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DUSP28Q4G0W2 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DUSP28Q4G0W2 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DUSP28Q4G0W2 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DUSP28Q4G0W2 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DUSP28Q4G0W2 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DUSP28Q4G0W2 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DUSP28Q4G0W2 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
DUSP28Q4G0W2 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DUSP28Q4G0W2 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DUSP28Q4G0W2 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DUSP28Q4G0W2 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DUSP28Q4G0W2 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DUSP28Q4G0W2 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
DUSP28Q4G0W2 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DUSP28Q4G0W2 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DUSP28Q4G0W2 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DUSP28Q4G0W2 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
DUSP28Q4G0W2 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DUSP28Q4G0W2 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DUSP28Q4G0W2 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DUSP28Q4G0W2 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DUSP28Q4G0W2 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
DUSP28Q4G0W2 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DUSP28Q4G0W2 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DUSP28Q4G0W2 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
DUSP28Q4G0W2 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
DUSP28Q4G0W2 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DUSP28Q4G0W2 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DUSP28Q4G0W2 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DUSP28Q4G0W2 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DUSP28Q4G0W2 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DUSP28Q4G0W2 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
DUSP28Q4G0W2 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
DUSP28Q4G0W2 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
DUSP28Q4G0W2 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
DUSP28Q4G0W2 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
DUSP28Q4G0W2 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
DUSP28Q4G0W2 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
DUSP28Q4G0W2 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
DUSP28Q4G0W2 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DUSP28Q4G0W2 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DUSP28Q4G0W2 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DUSP28Q4G0W2 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DUSP28Q4G0W2 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
DUSP28Q4G0W2 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DUSP28Q4G0W2 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DUSP28Q4G0W2 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DUSP28Q4G0W2 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DUSP28Q4G0W2 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DUSP28Q4G0W2 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DUSP28Q4G0W2 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DUSP28Q4G0W2 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DUSP28Q4G0W2 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DUSP28Q4G0W2 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DUSP28Q4G0W2 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DUSP28Q4G0W2 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DUSP28Q4G0W2 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DUSP28Q4G0W2 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DUSP28Q4G0W2 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DUSP28Q4G0W2 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
DUSP28Q4G0W2 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DUSP28Q4G0W2 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
DUSP28Q4G0W2 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DUSP28Q4G0W2 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
DUSP28Q4G0W2 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DUSP28Q4G0W2 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
DUSP28Q4G0W2 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DUSP28Q4G0W2 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DUSP28Q4G0W2 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
DUSP28Q4G0W2 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DUSP28Q4G0W2 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DUSP28Q4G0W2 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DUSP28Q4G0W2 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DUSP28Q4G0W2 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DUSP28Q4G0W2 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms