Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZCM7

TUBB8, Tubulin beta-8 chain, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB8Q3ZCM7 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TUBB8Q3ZCM7 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TUBB8Q3ZCM7 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TUBB8Q3ZCM7 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TUBB8Q3ZCM7 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TUBB8Q3ZCM7 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TUBB8Q3ZCM7 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TUBB8Q3ZCM7 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TUBB8Q3ZCM7 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TUBB8Q3ZCM7 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TUBB8Q3ZCM7 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TUBB8Q3ZCM7 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TUBB8Q3ZCM7 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TUBB8Q3ZCM7 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TUBB8Q3ZCM7 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TUBB8Q3ZCM7 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TUBB8Q3ZCM7 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TUBB8Q3ZCM7 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TUBB8Q3ZCM7 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TUBB8Q3ZCM7 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TUBB8Q3ZCM7 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TUBB8Q3ZCM7 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TUBB8Q3ZCM7 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TUBB8Q3ZCM7 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TUBB8Q3ZCM7 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TUBB8Q3ZCM7 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TUBB8Q3ZCM7 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TUBB8Q3ZCM7 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TUBB8Q3ZCM7 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TUBB8Q3ZCM7 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TUBB8Q3ZCM7 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TUBB8Q3ZCM7 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TUBB8Q3ZCM7 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TUBB8Q3ZCM7 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TUBB8Q3ZCM7 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TUBB8Q3ZCM7 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TUBB8Q3ZCM7 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TUBB8Q3ZCM7 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TUBB8Q3ZCM7 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TUBB8Q3ZCM7 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TUBB8Q3ZCM7 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TUBB8Q3ZCM7 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TUBB8Q3ZCM7 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TUBB8Q3ZCM7 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TUBB8Q3ZCM7 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TUBB8Q3ZCM7 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TUBB8Q3ZCM7 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TUBB8Q3ZCM7 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TUBB8Q3ZCM7 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TUBB8Q3ZCM7 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TUBB8Q3ZCM7 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TUBB8Q3ZCM7 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TUBB8Q3ZCM7 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TUBB8Q3ZCM7 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TUBB8Q3ZCM7 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TUBB8Q3ZCM7 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TUBB8Q3ZCM7 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TUBB8Q3ZCM7 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TUBB8Q3ZCM7 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TUBB8Q3ZCM7 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TUBB8Q3ZCM7 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TUBB8Q3ZCM7 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TUBB8Q3ZCM7 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TUBB8Q3ZCM7 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TUBB8Q3ZCM7 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TUBB8Q3ZCM7 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TUBB8Q3ZCM7 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TUBB8Q3ZCM7 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TUBB8Q3ZCM7 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TUBB8Q3ZCM7 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TUBB8Q3ZCM7 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TUBB8Q3ZCM7 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TUBB8Q3ZCM7 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TUBB8Q3ZCM7 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TUBB8Q3ZCM7 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TUBB8Q3ZCM7 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TUBB8Q3ZCM7 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TUBB8Q3ZCM7 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TUBB8Q3ZCM7 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TUBB8Q3ZCM7 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TUBB8Q3ZCM7 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TUBB8Q3ZCM7 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TUBB8Q3ZCM7 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TUBB8Q3ZCM7 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TUBB8Q3ZCM7 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TUBB8Q3ZCM7 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TUBB8Q3ZCM7 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TUBB8Q3ZCM7 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TUBB8Q3ZCM7 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TUBB8Q3ZCM7 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TUBB8Q3ZCM7 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TUBB8Q3ZCM7 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TUBB8Q3ZCM7 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TUBB8Q3ZCM7 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TUBB8Q3ZCM7 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TUBB8Q3ZCM7 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TUBB8Q3ZCM7 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TUBB8Q3ZCM7 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TUBB8Q3ZCM7 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TUBB8Q3ZCM7 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms