Protein–RNA interactions for Protein: Q3B8N5

PROX2, Prospero homeobox protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROX2Q3B8N5 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PROX2Q3B8N5 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PROX2Q3B8N5 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PROX2Q3B8N5 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PROX2Q3B8N5 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PROX2Q3B8N5 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
PROX2Q3B8N5 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
PROX2Q3B8N5 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PROX2Q3B8N5 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
PROX2Q3B8N5 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
PROX2Q3B8N5 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PROX2Q3B8N5 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PROX2Q3B8N5 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PROX2Q3B8N5 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PROX2Q3B8N5 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PROX2Q3B8N5 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PROX2Q3B8N5 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PROX2Q3B8N5 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PROX2Q3B8N5 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PROX2Q3B8N5 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PROX2Q3B8N5 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PROX2Q3B8N5 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PROX2Q3B8N5 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
PROX2Q3B8N5 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PROX2Q3B8N5 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PROX2Q3B8N5 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PROX2Q3B8N5 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PROX2Q3B8N5 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PROX2Q3B8N5 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PROX2Q3B8N5 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PROX2Q3B8N5 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PROX2Q3B8N5 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PROX2Q3B8N5 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PROX2Q3B8N5 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PROX2Q3B8N5 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PROX2Q3B8N5 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PROX2Q3B8N5 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PROX2Q3B8N5 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PROX2Q3B8N5 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PROX2Q3B8N5 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PROX2Q3B8N5 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PROX2Q3B8N5 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PROX2Q3B8N5 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PROX2Q3B8N5 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PROX2Q3B8N5 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PROX2Q3B8N5 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PROX2Q3B8N5 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PROX2Q3B8N5 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PROX2Q3B8N5 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PROX2Q3B8N5 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PROX2Q3B8N5 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PROX2Q3B8N5 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PROX2Q3B8N5 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PROX2Q3B8N5 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PROX2Q3B8N5 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PROX2Q3B8N5 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PROX2Q3B8N5 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PROX2Q3B8N5 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PROX2Q3B8N5 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PROX2Q3B8N5 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PROX2Q3B8N5 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PROX2Q3B8N5 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PROX2Q3B8N5 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PROX2Q3B8N5 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PROX2Q3B8N5 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PROX2Q3B8N5 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PROX2Q3B8N5 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PROX2Q3B8N5 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PROX2Q3B8N5 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PROX2Q3B8N5 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PROX2Q3B8N5 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PROX2Q3B8N5 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PROX2Q3B8N5 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PROX2Q3B8N5 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PROX2Q3B8N5 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PROX2Q3B8N5 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PROX2Q3B8N5 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PROX2Q3B8N5 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PROX2Q3B8N5 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PROX2Q3B8N5 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PROX2Q3B8N5 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PROX2Q3B8N5 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PROX2Q3B8N5 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PROX2Q3B8N5 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PROX2Q3B8N5 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PROX2Q3B8N5 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PROX2Q3B8N5 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PROX2Q3B8N5 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PROX2Q3B8N5 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PROX2Q3B8N5 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PROX2Q3B8N5 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PROX2Q3B8N5 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PROX2Q3B8N5 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PROX2Q3B8N5 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PROX2Q3B8N5 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PROX2Q3B8N5 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PROX2Q3B8N5 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PROX2Q3B8N5 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PROX2Q3B8N5 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PROX2Q3B8N5 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms