Protein–RNA interactions for Protein: Q32MZ4

LRRFIP1, Leucine-rich repeat flightless-interacting protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 808 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRFIP1Q32MZ4 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LRRFIP1Q32MZ4 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LRRFIP1Q32MZ4 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LRRFIP1Q32MZ4 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LRRFIP1Q32MZ4 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LRRFIP1Q32MZ4 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LRRFIP1Q32MZ4 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LRRFIP1Q32MZ4 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LRRFIP1Q32MZ4 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
LRRFIP1Q32MZ4 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LRRFIP1Q32MZ4 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LRRFIP1Q32MZ4 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LRRFIP1Q32MZ4 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LRRFIP1Q32MZ4 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LRRFIP1Q32MZ4 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LRRFIP1Q32MZ4 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LRRFIP1Q32MZ4 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LRRFIP1Q32MZ4 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LRRFIP1Q32MZ4 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
LRRFIP1Q32MZ4 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LRRFIP1Q32MZ4 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
LRRFIP1Q32MZ4 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
LRRFIP1Q32MZ4 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
LRRFIP1Q32MZ4 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
LRRFIP1Q32MZ4 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LRRFIP1Q32MZ4 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
LRRFIP1Q32MZ4 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LRRFIP1Q32MZ4 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LRRFIP1Q32MZ4 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LRRFIP1Q32MZ4 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LRRFIP1Q32MZ4 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LRRFIP1Q32MZ4 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
LRRFIP1Q32MZ4 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LRRFIP1Q32MZ4 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LRRFIP1Q32MZ4 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LRRFIP1Q32MZ4 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LRRFIP1Q32MZ4 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LRRFIP1Q32MZ4 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LRRFIP1Q32MZ4 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
LRRFIP1Q32MZ4 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
LRRFIP1Q32MZ4 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LRRFIP1Q32MZ4 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LRRFIP1Q32MZ4 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LRRFIP1Q32MZ4 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LRRFIP1Q32MZ4 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LRRFIP1Q32MZ4 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LRRFIP1Q32MZ4 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LRRFIP1Q32MZ4 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LRRFIP1Q32MZ4 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LRRFIP1Q32MZ4 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LRRFIP1Q32MZ4 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LRRFIP1Q32MZ4 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LRRFIP1Q32MZ4 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LRRFIP1Q32MZ4 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LRRFIP1Q32MZ4 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LRRFIP1Q32MZ4 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LRRFIP1Q32MZ4 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LRRFIP1Q32MZ4 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LRRFIP1Q32MZ4 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
LRRFIP1Q32MZ4 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LRRFIP1Q32MZ4 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LRRFIP1Q32MZ4 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LRRFIP1Q32MZ4 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
LRRFIP1Q32MZ4 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LRRFIP1Q32MZ4 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LRRFIP1Q32MZ4 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LRRFIP1Q32MZ4 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LRRFIP1Q32MZ4 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LRRFIP1Q32MZ4 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LRRFIP1Q32MZ4 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LRRFIP1Q32MZ4 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LRRFIP1Q32MZ4 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LRRFIP1Q32MZ4 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LRRFIP1Q32MZ4 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LRRFIP1Q32MZ4 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LRRFIP1Q32MZ4 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LRRFIP1Q32MZ4 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LRRFIP1Q32MZ4 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LRRFIP1Q32MZ4 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LRRFIP1Q32MZ4 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LRRFIP1Q32MZ4 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LRRFIP1Q32MZ4 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LRRFIP1Q32MZ4 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LRRFIP1Q32MZ4 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LRRFIP1Q32MZ4 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LRRFIP1Q32MZ4 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LRRFIP1Q32MZ4 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LRRFIP1Q32MZ4 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
LRRFIP1Q32MZ4 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LRRFIP1Q32MZ4 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LRRFIP1Q32MZ4 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
LRRFIP1Q32MZ4 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LRRFIP1Q32MZ4 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
LRRFIP1Q32MZ4 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LRRFIP1Q32MZ4 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LRRFIP1Q32MZ4 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LRRFIP1Q32MZ4 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LRRFIP1Q32MZ4 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LRRFIP1Q32MZ4 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LRRFIP1Q32MZ4 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms